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标题: 求助在Gaussian建模时，大分子结构怎样解决手性碳问题 [打印本页]

作者
Author: 莫俆 时间: 2022-5-11 09:30
标题: 求助在Gaussian建模时，大分子结构怎样解决手性碳问题
在Gaussian建模时，大分子结构存在多个手性碳，在进行结构优化时自动会调节位置，还是需要构建多个分子结构进行结构优化选能量最低。
手性分子呢？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2022-5-11 09:36
构型问题：建模时确定好
构象问题：简单分子自己摆成合适结构，复杂分子做构象搜索，这和分子有没有手性中心没有关系。

作者
Author: 莫俆 时间: 2022-5-11 11:01

liyuanhe211 发表于 2022-5-11 09:36
构型问题：建模时确定好
构象问题：简单分子自己摆成合适结构，复杂分子做构象搜索，这和分子有没有手性中 ...

感谢回复，还是不太明白，就是说构型中大分子结构（如1000）需要根据每个手心碳设计多个构型，再结构优化选能量最低，然后在进行构象检索

作者
Author: flyingchow 时间: 2022-5-11 11:07

莫俆发表于 2022-5-11 11:01
感谢回复，还是不太明白，就是说构型中大分子结构（如1000）需要根据每个手心碳设计多个构型，再结构优化 ...

要学会用open babel

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2022-5-11 12:05

莫俆发表于 2022-5-11 11:01
感谢回复，还是不太明白，就是说构型中大分子结构（如1000）需要根据每个手心碳设计多个构型，再结构优化 ...

“如1000” 1000什么
啥叫根据每个手性碳设计构型？你确定你分清构型和构象了嘛？
不同构型一般不能相互转化你选能量最低的干什么？

作者
Author: 莫俆 时间: 2022-5-11 12:44
本帖最后由莫俆于 2022-5-11 12:59 编辑

liyuanhe211 发表于 2022-5-11 12:05
“如1000” 1000什么
啥叫根据每个手性碳设计构型？你确定你分清构型和构象了嘛？
不同构型一般不能相 ...

嗯，1000为分子量，我的意思是由于手性碳存在，每个手性碳有两种构型，如果含有n个手性碳是否需要考虑组成多种不同构型

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-11 13:56

莫俆发表于 2022-5-11 05:44
嗯，1000为分子量，我的意思是由于手性碳存在，每个手性碳有两种构型，如果含有n个手性碳是否需要考虑组 ...

对，但是对于构型来说，能量最低的不一定是最合理的，正确构型只取决于你是怎么合成这个分子的，而不取决于哪个构型能量最低。这个和构象不一样。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-11 17:54
分清楚Gaussian和GaussView
Gaussian是计算程序，根本没有建模功能

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