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标题: 求助：用于改变帧保存间隔是否需要全部重跑的疑问 [打印本页]

作者
Author: Lisy 时间: 2022-5-12 11:04
标题: 求助：用于改变帧保存间隔是否需要全部重跑的疑问
我跑几十ns的gromacs一开始用的保存帧间隔是每1ps保存一帧，后面想提取其中几百ps来做后处理分析。可是我那个分析需要的帧间隔是0.2ps，误差才会比较小。那我是需要重新改变帧间隔，重新跑几十纳秒来分析还是可以直接用一开始的条件模拟得到的md.gro，然后改变md.mdp的设置跑几百ps就可以？

作者
Author: Frozen-Penguin 时间: 2022-5-12 15:42
和你要分析的内容有关，假设一段时间模拟后体系已经达到平衡，如果你要分析平衡状态的性质，就从md.gro开始，时间不用很长，因为此时已经平衡了，不会有很大变化，如果你要分析从初始结构到平衡状态的变化过程，就从最初的结构开始。

作者
Author: Lisy 时间: 2022-5-12 16:03

Frozen-Penguin 发表于 2022-5-12 15:42
和你要分析的内容有关，假设一段时间模拟后体系已经达到平衡，如果你要分析平衡状态的性质，就从md.gro开始 ...

好的，谢谢您！我只需要分析平衡之后的性质~

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