计算化学公社

标题: 请教老师们量化软件中内坐标的表示形式 [打印本页]

作者
Author:
Markmahao    时间: 2022-5-13 09:44
标题: 请教老师们量化软件中内坐标的表示形式
各位老师好,      我看有些书上写的笛卡尔坐标到内坐标变换方法为:S=B*X,其中B是变换矩阵,X是笛卡尔坐标,S是内坐标。所以请问各位老师,这个公式里面的S和我们常见的内坐标的格式是一样的吗?还是需要做单位变化?因为矩阵的正确形式没见过,能否给一个小分子的例子?十分感谢!


例如水分子:
O              
H                  1    0.96000000
H                  1    0.96000000    2  109.49999976

它的S是啥样的呢?

作者
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wzkchem5    时间: 2022-5-13 14:45
可以变化单位,也可以不变化。只要S和B、X的单位统一即可
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-5-14 00:17
看J. Chem. Phys., 117, 9160 (2022),里面写得很详细。注意并不是S=B*X,而是δS=B*δX,内坐标和笛卡尔坐标之间不是线性变换关系。
作者
Author:
Markmahao    时间: 2022-5-14 09:20
wzkchem5 发表于 2022-5-13 14:45
可以变化单位,也可以不变化。只要S和B、X的单位统一即可

谢谢老师!
作者
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Markmahao    时间: 2022-5-14 09:23
sobereva 发表于 2022-5-14 00:17
看J. Chem. Phys., 117, 9160 (2022),里面写得很详细。注意并不是S=B*X,而是δS=B*δX,内坐标和笛卡尔坐 ...

谢谢sob老师,我去查看一下那篇文章。




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