计算化学公社

标题: 使用RESP懒人脚本计算时报错forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fau... [打印本页]

作者
Author: dzdhp 时间: 2022-5-13 11:27
标题: 使用RESP懒人脚本计算时报错forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fau...
前几天计算的时候还是正常的，后来装了个gmx-MMPBSA，今天天计算就报错，文件夹里也没有输出文件，请教一下各位老师是什么原因，非常感谢 (, 下载次数 Times of downloads: 9)
用的是sob的Mul结合ORCA一键计算resp电荷的脚本，命令是./RESP_ORCA.sh xbj.mol2 +1自旋多重度默认1，溶剂默认水。
脚本调用Mul的命令应该是这个
### Calculate RESP charges
echo Running Multiwfn...
Multiwfn SP.molden -ispecial 1 > /dev/null << EOF
7
18
1
y
0
0
q
EOF

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-13 14:40
贴出脚本调用Multiwfn的完整命令，以及相关的输入文件

作者
Author: dzdhp 时间: 2022-5-13 15:09

wzkchem5 发表于 2022-5-13 14:40
贴出脚本调用Multiwfn的完整命令，以及相关的输入文件

老师您好，命令和输入文件已上传，感谢您的指导

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-14 00:25
没有叫Mul的程序，我极度反感以任何形式简写Multiwfn

仔细看此文，搞清楚脚本运行机制
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html）

如果当前目录下已经出现了给Multiwfn用的molden文件，按下文手动用Multiwfn算RESP电荷看具体出现什么情况（Multiwfn输出的信息全拷到文本文件里上传）
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）

作者
Author: dzdhp 时间: 2022-5-14 10:07

sobereva 发表于 2022-5-14 00:25
没有叫Mul的程序，我极度反感以任何形式简写Multiwfn

仔细看此文，搞清楚脚本运行机制

抱歉sobereva老师，下次不会再犯了，非常感谢老师的指导

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