计算化学公社

标题: 求助：锂层中锂的力场参数 [打印本页]

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-14 19:29
标题: 求助：锂层中锂的力场参数
各位老师好：如下图，我使用packmol构建了锂金属负极和电解液体系，准备用Gromacs进行MD模拟。请问下面的锂层应该使用什么力场啊？

作者
Author: 心向暖阳 时间: 2022-5-14 20:03
http://sobereva.com/153
看一下这个可能有帮助

作者
Author: 牧生 时间: 2022-5-14 20:53

心向暖阳发表于 2022-5-14 20:03
http://sobereva.com/153
看一下这个可能有帮助

楼主想要的应该是金属锂的参数。似乎文献中还没有报道过单质金属锂的参数

作者
Author: 妙角不脆 时间: 2022-5-14 21:19
金属单质好多都没有现成参数，恐怕得自己想办法拟合。

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-14 21:36

牧生发表于 2022-5-14 20:53
楼主想要的应该是金属锂的参数。似乎文献中还没有报道过单质金属锂的参数

是的，找了很多都是锂离子的参数

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-14 21:36

妙角不脆发表于 2022-5-14 21:19
金属单质好多都没有现成参数，恐怕得自己想办法拟合。

好吧，感谢回复

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-14 21:37

心向暖阳发表于 2022-5-14 20:03
http://sobereva.com/153
看一下这个可能有帮助

好的吗，我去看看

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-14 23:52

xjw 发表于 2022-5-14 21:36
是的，找了很多都是锂离子的参数

明显是你找的方式不对
Google学术里搜GROMACS Li slab，第一篇就是用GROMACS模拟含Li板的文章Electrochimica Acta 234 (2017) 43–51，里面直接给了Li的LJ参数

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-15 10:37

sobereva 发表于 2022-5-14 23:52
明显是你找的方式不对
Google学术里搜GROMACS Li slab，第一篇就是用GROMACS模拟含Li板的文章Electrochi ...

谢谢老师，我去看看

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-15 11:36

sobereva 发表于 2022-5-14 23:52
明显是你找的方式不对
Google学术里搜GROMACS Li slab，第一篇就是用GROMACS模拟含Li板的文章Electrochi ...

老师您好，我在那篇文章中找到了Li的参数。但是看这篇文章的时候有一个新问题。我看在下图中的这句。文中除了锂层的参数外，PEO用到了OPLS-AA的力场参数，但是锂离子用的是GAFF力场参数。我在论坛中找到，GAFF力场和Amber力场是可以兼用的。但是OPLS-AA和GAFF也可以兼用嘛？为什么一个体系可以同时使用这两种力场啊？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-15 21:44

xjw 发表于 2022-5-15 11:36
老师您好，我在那篇文章中找到了Li的参数。但是看这篇文章的时候有一个新问题。我看在下图中的这句。文中 ...

没任何必要效仿
Li以外的部分都用GAFF就完了

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-16 11:19

sobereva 发表于 2022-5-15 21:44
没任何必要效仿
Li以外的部分都用GAFF就完了

嗯嗯，那请问老师。那个文章中Li金属的参数可以直接和GAFF力场一起用嘛？需要做一定的转换嘛？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-17 02:12

xjw 发表于 2022-5-16 11:19
嗯嗯，那请问老师。那个文章中Li金属的参数可以直接和GAFF力场一起用嘛？需要做一定的转换嘛？

可

作者
Author: xjw 时间: 2022-5-17 13:34

sobereva 发表于 2022-5-17 02:12
可

好的，谢谢老师

作者
Author: 602015617 时间: 2023-3-28 09:25

sobereva 发表于 2022-5-15 21:44
没任何必要效仿
Li以外的部分都用GAFF就完了

请问老师，这个Li金属的势参数与电解液原子（OPLS-AA）的vdW势参数之间的组合规则怎么确定呢？sigma是用几何平均吗

作者
Author: gjs 时间: 2024-5-2 11:53

xjw 发表于 2022-5-16 11:19
嗯嗯，那请问老师。那个文章中Li金属的参数可以直接和GAFF力场一起用嘛？需要做一定的转换嘛？

同学您好，可以请教一下如何根据这个Li金属板的LJ参数去制作它的itp文件呢，您做出来了吗，谢谢。

作者
Author: mouyulan 时间: 2024-9-5 21:32

602015617 发表于 2023-3-28 09:25
请问老师，这个Li金属的势参数与电解液原子（OPLS-AA）的vdW势参数之间的组合规则怎么确定呢？sigma是用 ...

请问您解决这个问题了吗

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