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标题: 关于VMD保持整体显示同时如何给选中的原子不同的显示方式 [打印本页]

作者
Author: 杨天奇 时间: 2022-5-14 21:07
标题: 关于VMD保持整体显示同时如何给选中的原子不同的显示方式
请教一下各位老师和同学，我用gromacs跑完动力学的gro文件载入到VMD之中，然后怎么给特定的原子和其他原子不同的显示方式呢。大致就是和下面这种图一样，选中Na+离子然后显示Na+离子边上的一些原子，我学习了一下论坛里的帖子然后学会了显示Li+离子边上5埃米的原子，但是这样显示的时候整体搭建的体系就消失了，有以下几个问题请教一下各位老师和同学：①他的图是显示方式是drawing method整体用的lines，然后前面显示用的CPK嘛。
②我要怎么操作就是显示Li+离子边上的原子的同时把整体的结构留下来呢。
下面是文献的图，我的图，还有跑完动力学的gro文件，感谢各位老师和同学指点。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-14 23:48
Graphics - representation里可以创建多个rep，每个rep都可以单独定义选区、显示方式等设置。实际看到的图是所有rep的叠加。

作者
Author: 杨天奇 时间: 2022-5-15 00:36

sobereva 发表于 2022-5-14 23:48
Graphics - representation里可以创建多个rep，每个rep都可以单独定义选区、显示方式等设置。实际看到的图 ...

好的感谢Sob老师的指导！我去尝试一下！

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