计算化学公社

标题: 求助-MS的trj轨迹转化 [打印本页]

作者
Author: Sasuke 时间: 2022-5-16 00:17
标题: 求助-MS的trj轨迹转化
本帖最后由 Sasuke 于 2022-5-16 00:31 编辑

本人之前一直用lammps做分子动力学模拟，用xrd库读取xtc轨迹文件，最近想用MS做一些工作，现在不知道怎么把MS产生的.trj轨迹文件转换成xtc文件，目前知道可以用MS自带的trj2ascii.exe程序将.trj转为文本文件，可否通过什么方法再转化成XTC文件呢？
或者XTC文件转化成文本文件后内容的格式是什么样的？如果知道的话，可以写个脚本先将trj文件转化为XTC内容形式然后再转化为二进制的轨迹？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-16 01:21
你只要能转成VMD可以读的轨迹格式，就能在载入VMD之后保存成GROMACS的trr轨迹格式，如果非想要xtc轨迹，再用trjconv转就完了

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)