计算化学公社

标题: 计算mci-pi和AV1245-pi时如何合理选取pi轨道 [打印本页]

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Author: radical 时间: 2022-5-17 17:06
标题: 计算mci-pi和AV1245-pi时如何合理选取pi轨道
1.在利用multiwfn中轨道定域化功能识别出LMO-pi,由于识别单中心轨道所取的阈值不同导致得到的轨道数和电子数不同，这个时候是否可以利用multiwfn考察分子轨道成分的功能，得到与LMO相同序号的分子轨道pi成分，然后再将与pi轨道成分很低(比如低于50%）的分子轨道序号相同的LMO不考虑，从而去计算MCI-pi和AV1245-pi
2.对于下面这个分子轨道再阈值为85%认为是LMO-pi轨道，阈值设为80%则被认为是单中心轨道，分别在2种不同阈值设置下对分子轨道做成分分析，在85%下这一轨道的pi成分是63.2%，80%下则是37.3%，，想要问一下轨道图如下的LMO是否要看做pi轨道去进行AICD和多中心键级等等去进行计算

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Author: sobereva 时间: 2022-5-17 18:13
1 随机应变。可以先调整阈值尽可能让程序判断出来比较多的pi型LMO轨道，然后肉眼挨个检查判断出来的，不想要的再手动用主功能6的子功能26将其占据数清零

2 这个有孤对电子轨道的特征，是否视为pi轨道模棱两可
可以计算C-N的Mayer键级，如果总的来说接近2，说明C-N的pi作用显著，可以把这个姑且算是pi轨道

另外，sigma和pi的定义在不同情况语境不同。很多时候把不是sigma的都视为pi轨道，哪怕其实有的是明显的孤对电子轨道。

你的体系不牵扯到sigma电子参与多中心共轭，所以没必要特意选出来pi轨道来算MCI-pi和AV1245-pi。

作者
Author: radical 时间: 2022-5-18 11:02
本帖最后由 radical 于 2022-5-18 11:17 编辑

sobereva 发表于 2022-5-17 18:13
1 随机应变。可以先调整阈值尽可能让程序判断出来比较多的pi型LMO轨道，然后肉眼挨个检查判断出来的，不想 ...

谢谢sob老师，那么在考察共轭路径的芳香性时，需要将孤对电子考虑到吗，并且计算了C3-N5和C4-N5的Mayer键级，各自都是1.0，就是单纯的sigma键

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-18 21:51

radical 发表于 2022-5-18 11:02
谢谢sob老师，那么在考察共轭路径的芳香性时，需要将孤对电子考虑到吗，并且计算了C3-N5和C4-N5的Mayer键 ...

前面说了，此体系没有sigma共轭，因此没有必要特意挑轨道算pi的值

作者
Author: radical 时间: 2022-5-20 09:52

sobereva 发表于 2022-5-18 21:51
前面说了，此体系没有sigma共轭，因此没有必要特意挑轨道算pi的值

sob老师，不区分sigma和pi轨道去算了一下芳香性，MCI,AV1245和NICS之间的差异性比较大，没有办法对体系的芳香性大小进行合理的排序，所以想着可不可以通过挑选pi轨道来使得几种芳香性指标趋向一致

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-21 04:20

radical 发表于 2022-5-20 09:52
sob老师，不区分sigma和pi轨道去算了一下芳香性，MCI,AV1245和NICS之间的差异性比较大，没有办法对体系的 ...

没意义
诸如苯，所有电子对应的碳环的MCI是0.0863，MCI-pi是0.0837，基本没区别

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