计算化学公社

标题: vasp 6.3 机器学习的问题 [打印本页]

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gaussian08    时间: 2022-5-18 15:56
标题: vasp 6.3 机器学习的问题
大家好,我打算用vasp6.3的机器学习模拟离子液体相行为,初始模拟盒子有200多个原子,开始跑NVT,
一直报如下错误: (, 下载次数 Times of downloads: 28)
我的INCAR: (, 下载次数 Times of downloads: 21)
是不是我的原子太多?还是因为什么?
大家给点建议
另外,后面跑NPT,不知道PSTRESS是控压么?

作者
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Xu98H    时间: 2022-5-18 16:26
根据ML_AB文件里(下图)修改ML_MB参数
作者
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gaussian08    时间: 2022-5-18 17:27
Xu98H 发表于 2022-5-18 16:26
根据ML_AB文件里(下图)修改ML_MB参数

ML_MB=这些数加起来?
另外一个问题,能跑NPT么,因为我这个体系是液体,需要加压,上面INCAR对么?

作者
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黑色桃花    时间: 2022-5-18 18:04
机器学习会加快运算的速度嘛?是因为算法的变化嘛

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szp12345    时间: 2022-5-19 22:48
应该是学习不到精确的力场参数。
你看一下ML_LOGFILE文件记录的学习过程(grep STATUS ML_LOGFILE),看是不是经常出现threshold状态。
作者
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gaussian08    时间: 2022-5-20 08:44
本帖最后由 gaussian08 于 2022-5-20 09:27 编辑

是的,发现accurate 和threshold交替出现,但大部分是accurate,如图:

像这种情况,应该怎么修改?是初始结构的问题还是INCAR参数的问题?还有一个问题就是:如果得到了accurate forcefield,能扩体积计算么?还是只能模拟初始结构的体积?




作者
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343333333    时间: 2022-5-26 21:13
gaussian08 发表于 2022-5-20 08:44
是的,发现accurate 和threshold交替出现,但大部分是accurate,如图:

像这种情况,应该怎么修改?是初 ...

1、AT交互出现有可能是你logfile文件中BEEF的 threshold 的阈值在不停变化
2、可以先查看logfile里面的ERR信息,看机器学习力场和aimd的误差。如果误差很小(催化体系中一般认为E<10-6 ev/Atom并且F<5*10-2 eV/A)则可以推断模型可用。至于模型的迁移性,如果你的相空间内的md原子环境内包含了你扩胞体系中的所有化学环境,那从SOAP原理上是可以外推的,至于外推的稳定性就得根据体系来具体问题具体讨论了。
作者
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yangzhanlin    时间: 2022-10-14 09:24
gaussian08 发表于 2022-5-18 17:27
ML_MB=这些数加起来?
另外一个问题,能跑NPT么,因为我这个体系是液体,需要加压,上面INCAR对么?

你好,这个问题请问最后是怎么解决的?我也遇到了同样的问题
作者
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郑明    时间: 2023-3-19 14:28
343333333 发表于 2022-5-26 21:13
1、AT交互出现有可能是你logfile文件中BEEF的 threshold 的阈值在不停变化
2、可以先查看logfile里面的E ...

你好请教一下。这里说的误差很小指的是贝叶斯误差还是模型学习时候的ERR误差?




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