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标题: 已解决 | 求助更改原子的name和type属性 [打印本页]

作者
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ZZU_SCU    时间: 2022-5-18 17:23
标题: 已解决 | 求助更改原子的name和type属性
本帖最后由 ZZU_SCU 于 2022-6-3 22:59 编辑

各位老师,在VMD打开分子动力学模拟文件。原子的name和type显示为数字1234,怎么更改为元素CHON呢?左侧打开是输入文件,右侧打开的是输出文件。万分感谢。如果不能修改麻烦卢老师告知一声
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作者
Author:
ZZU_SCU    时间: 2022-6-3 22:58
已解决,可以在lammps的输入文件中加入以下代码
  1. dump 1 all xyz 100 dump.xyz
  2. dump_modify 1 element C1 H1 N1 O1 C2
复制代码

输出的dump.xyz可以被VMD识别出来元素,包括氢键等。

没有找到VMD修改原子属性的方法




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