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标题: 利用sobtop基于DRIH方法产生的CO2拓步文件如何检验合理性 [打印本页]

作者
Author: 五月雨 时间: 2022-5-18 22:05
标题: 利用sobtop基于DRIH方法产生的CO2拓步文件如何检验合理性
本帖最后由五月雨于 2022-5-18 22:08 编辑

1、各位老师好，我对基于DRIH方法产生的CO2拓步文件在真空、常温常压下跑了100ns的NPT，对平衡密度和扩散系数进行了简单的验证，数据符合的话是不是就可以代表拓扑文件的合理性？
2、之所以不使用像EPM2、TraPPE等使用较为广泛的CO2模型，是因为我已经基本测试了目前主流的CO2势模型，虽然可以和实验数据相当符合，但就是在常温常压下无法形成聚集体(有溶剂及小分子有机物存在的时候)，我想要对常温常压下的团簇进行分析，所以没有办法使用。

3、但就是一开始当作学习sobtop时随意产生的拓扑文件，反而在有溶剂的情况下形成了聚集体。

还请各位老师指点，是否可以在正式模拟中去使用。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-18 23:15
1 参考CO2专门的力场原文里是怎么验证力场的

2 常温常压下CO2极其稀疏，而且CO2和其它分子间相互作用甚弱，形成不了聚集体才是正常的

作者
Author: 五月雨 时间: 2022-5-18 23:29
本帖最后由五月雨于 2022-5-19 11:03 编辑

sobereva 发表于 2022-5-18 23:15
1 参考CO2专门的力场原文里是怎么验证力场的

我参考的一篇文献是使用GROMOS54A7力场下进行的，有聚集相的产生，也不是使用主流的势模型，感觉结果凑的比较刻意。

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