计算化学公社

标题: 求助关于ICSS研究芳香性的问题 [打印本页]

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2022-5-23 20:41
标题: 求助关于ICSS研究芳香性的问题
sob大神及各位老师，我正在按照帖子http://sobereva.com/216（通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性），用benzene压缩包里的文件，按照步骤操作，等值面的图都是好的，但是填色图出现了一点问题： (, 下载次数 Times of downloads: 24) 这是文章中的例图。
(, 下载次数 Times of downloads: 28) 这是我按照步骤做出来的图。
存在的问题：1.颜色较浅，说明NICS(1)ZZ值过小；2.右边刻度线太密，不知如何调整；3.等值线与例图不一样。
这是使用sob老师给的文件计算出来的结果。后来我又用examples中的gjf文件重新提交去计算，在使用脚本runall.sh时，用. runall.sh命令调用脚本，出现了这种情况 (, 下载次数 Times of downloads: 19)
出现out文件，但是大小都是0k，不知道是什么原因？脚本需要改写吗？
谢谢各位老师

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-24 03:48
1 后处理菜单修改标签刻度，仔细一看就知道是什么选项

色彩刻度轴对应Z轴

2 提示写明了，g09命令没法运行，显然Gaussian 09没装好
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2022-5-24 11:14

sobereva 发表于 2022-5-24 03:48
1 后处理菜单修改标签刻度，仔细一看就知道是什么选项

色彩刻度轴对应Z轴

谢谢sob老师，我再试试

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2022-5-24 14:48

sobereva 发表于 2022-5-24 03:48
1 后处理菜单修改标签刻度，仔细一看就知道是什么选项

色彩刻度轴对应Z轴

sob老师，我按您说的调了下z轴得刻度，和范围，按照文章中得顺序一步步做下来了，现在问题只解决了这三个“1.颜色较浅，说明NICS(1)ZZ值过小；2.右边刻度线太密，不知如何调整；3.等值线与例图不一样。“中得第二个，中心颜色浅和等值线都没有解决，您看是哪里出了问题？ (, 下载次数 Times of downloads: 23)

这是换了z轴得刻度，和范围做的图
(, 下载次数 Times of downloads: 20)
这是程序里得参数

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-25 04:38

wocaishiniu 发表于 2022-5-24 14:48
sob老师，我按您说的调了下z轴得刻度，和范围，按照文章中得顺序一步步做下来了，现在问题只解决了这三个 ...

ICSS_ZZ大小同时取决于颜色和色彩刻度范围
色彩差异不够鲜明就改色彩刻度范围就完了
等值线数值不合乎自己的期望就改等值线设置就完了
选项都在后处理菜单里。仔细把Multiwfn手册4.4节绘制平面图的一大把例子看一遍，了解相关选项的使用

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2022-5-25 15:45
本帖最后由 wocaishiniu 于 2022-5-25 16:02 编辑

sobereva 发表于 2022-5-25 04:38
ICSS_ZZ大小同时取决于颜色和色彩刻度范围
色彩差异不够鲜明就改色彩刻度范围就完了
等值线数值不合乎 ...

再次感谢sob老师的耐心解答，苯的这个已经解决了，但是我用azulene.gjf去计算，计算完以后等值面的图跟您文章中的实例图一样，但是填色图又出现问题了。 (, 下载次数 Times of downloads: 19)
都是绿，等值线什么的都没有了，不知道这是什么原因造成的，还请您能帮我解答一下，谢谢sob老师

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-26 05:38

wocaishiniu 发表于 2022-5-25 15:45
再次感谢sob老师的耐心解答，苯的这个已经解决了，但是我用azulene.gjf去计算，计算完以后等值面的图跟您 ...

仔细看图片蹦出来的时候文本窗口显示的平面数据的最大、最小值，如果都是0，说明操作有问题，诸如载入的文件不对、iuserfunc没改，等等

作者
Author: wocaishiniu 时间: 2022-5-26 08:32
本帖最后由 wocaishiniu 于 2022-5-26 10:29 编辑

sobereva 发表于 2022-5-26 05:38
仔细看图片蹦出来的时候文本窗口显示的平面数据的最大、最小值，如果都是0，说明操作有问题，诸如载入的 ...

sob老师，已经解决了，之前的iuserfunc虽然设置到-1了，但是重新载入另一个cub文件以后，setting.ini，还是-1，但是仔细看了一边，刚选择4以后，显示iuserfunc=0，所以我就把setting.ini里面的-1重新保存了一下，后面就正常了，谢谢sob老师！

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