计算化学公社

标题: QM/MM两个区域的能量相加,两者是否为一个尺度,为什么能直接相加? [打印本页]

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sylar    时间: 2022-5-23 21:25
标题: QM/MM两个区域的能量相加,两者是否为一个尺度,为什么能直接相加?
请教各位老师几个问题:
1.QM/MM中的单点能是QM区域的单点与MM区域的能量相加,但QM区域少量原子的能量数值远大于MM区域,这两个能量的尺度(不知道这个说法合不合适,我想说的不同于两者单位)是否一样?

2.为什么可以直接相加来描述整个体系能量?看到Sob提到过ONIOM会带来误差,QM/MM是如何避免带来误差的?




另外能否推荐一些书籍或文献来补这部分的理论基础,谢谢大家


作者
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yjb    时间: 2022-5-23 22:50
我的理解是 1)QM区域是量化力学上,MM是分子力学,本身方法就不同所以算出来的能量没有可比性。单位应该都是Hartree。2)E=QM+MM+QMMM,主要是QMMM部分的长程相互作用可能会带来误差。ONIOM可能用的机械嵌入的方法。以上都是我个人的理解,可能有不对的地方。
作者
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sobereva    时间: 2022-5-24 03:34
1 本来绝对能量就没有实际意义,实际研究感兴趣的总是两个状态的相对能量,各种级别都可以用来计算相对能量,物理意义是相同的。算相对能量根本不需要顾虑不同级别的绝对能量的尺度和物理意义差异的问题。

2 明白了上面说的,自然就知道相加是没有问题的。但绝对不是简单相加,还必须考虑QM和MM部分的耦合,随便找个介绍QM/MM的资料都会说

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ONIOM(QM:MM)和QM/MM都有力学嵌入和电子嵌入两种实现,相同级别时对层间作用的描述没有本质差异。

作者
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sylar    时间: 2022-5-24 09:19
sobereva 发表于 2022-5-24 03:34
1 本来绝对能量就没有实际意义,实际研究感兴趣的总是两个状态的相对能量,各种级别都可以用来计算相对能量 ...

谢谢老师解答




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