计算化学公社

标题: 求助,做径向分布函数时候,ndx文件分组问题 [打印本页]

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小柏桐    时间: 2022-5-25 10:34
标题: 求助,做径向分布函数时候,ndx文件分组问题
产生的组中,SO是一个硫酸根,我想做Ca2+和硫酸根中氧的径向分布函数,怎么做呀

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Frozen-Penguin    时间: 2022-5-25 12:50
11 & a O
这样可以选中硫酸根里面的氧原子
如果pdb文件里氧原子的名字不是‘O',把命令里面的’O'改成pdb里面的名称
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小柏桐    时间: 2022-5-25 16:29
谢谢

作者
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小柏桐    时间: 2022-5-25 16:47
出现了错误
(, 下载次数 Times of downloads: 28)
作者
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sobereva    时间: 2022-5-26 03:38
小柏桐 发表于 2022-5-25 16:47
出现了错误

你当前的界面和你1L的界面根本不是同一个
仔细看清楚屏幕上的提示,当前让你选择组号,又不是make_ndx那样能用选择语句
作者
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小柏桐    时间: 2022-5-26 09:10
sobereva 发表于 2022-5-26 03:38
你当前的界面和你1L的界面根本不是同一个
仔细看清楚屏幕上的提示,当前让你选择组号,又不是make_ndx那 ...

谢谢老师,已解决




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