计算化学公社

标题: 求助：VMD做径向分布函数时候，selection输入错误 [打印本页]

作者
Author: 小柏桐 时间: 2022-5-25 21:07
标题: 求助：VMD做径向分布函数时候，selection输入错误
我的体系中有Ca2+, SO42-,在.gro文件中SO42-名字是 SO OS，在用VMD做径向分布函数时，selection提示错误
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作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-26 03:20
仔细看此文
直接写Ca2+显然不认
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

resname 'CA2+'：残基名是CA2+的原子（二价钙离子）。名字带正负号的也要用单引号括住以免转义

作者
Author: 小柏桐 时间: 2022-5-26 09:38
还是出错了，我在selected moleculer窗口选择name 没有任何东西

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作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-30 06:07

小柏桐发表于 2022-5-26 09:38
还是出错了，我在selected moleculer窗口选择name 没有任何东西

估计是你载入trr之前没载入结构文件，此时程序根本都不知道体系里的原子名是什么

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