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标题: 请教gmx_mpi select中-selcet选项怎么写选区语句? [打印本页]

作者
Author:
灵芝5    时间: 2022-5-28 12:05
标题: 请教gmx_mpi select中-selcet选项怎么写选区语句?
您好!我在分析一个带NaCl离子的6聚体蛋白的轨迹,现在想选中距离某一条链(假设是A链)8号残基5埃范围内的Cl离子;

想请问一下如果用gmx_mpi select指令的话,-select选项应该怎么写语句可以选中这一范围内的Cl离子?

作者
Author:
Frozen-Penguin    时间: 2022-5-28 12:31
within 0.5 of resnr 8 and name Cl-
选取8号残基附近并且原子名为Cl-的原子





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