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标题: ORCA计算分子轨道能级，怎么指定计算某两个原子间的电子轨道能级 [打印本页]

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-28 20:50
标题: ORCA计算分子轨道能级，怎么指定计算某两个原子间的电子轨道能级
请问ORCA计算分子轨道能级，希望指定计算某两个原子间的电子轨道能级（体系较大），指定原子的语句在输入文件中怎么写，在手册中没找到……；另外，请问各位都是怎么登上orca的官网的……我特殊姿势上网也进不去……

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-28 20:57
分子轨道都是离域在整个分子上的，没有”某两个原子间的电子轨道能级“这个概念。
如果你是从某篇文献看到的这个概念，贴文献原文上来。如果不是从文献看来的而是自己发明的概念，说明一下你为什么想算这个，我们看看可以用什么计算来替代。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-28 21:03
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“Orca输入文件”改了，以后务必注意，下次将删帖+扣分处理。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-28 21:05
至少我发帖的此时此刻，在大陆以外地区访问ORCA论坛是正常的。既可能你赶巧正好论坛有问题，要么就是姿势不对。

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-28 21:07

sobereva 发表于 2022-5-28 21:03
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

抱歉抱歉，谢谢社长，下次一定注意！！

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-28 21:25
本帖最后由 Apethie 于 2022-5-28 21:30 编辑

wzkchem5 发表于 2022-5-28 20:57
分子轨道都是离域在整个分子上的，没有”某两个原子间的电子轨道能级“这个概念。
如果你是从某篇文献看到 ...

谢谢您，我是想画分子轨道杂化图（类似附件图片），因此想计算一下某两个原子之间的轨道大致分布，来做个参考。
图片来自C:\Users\Irene\Desktop\11.pngJ. Phys. Chem. C 2014, 118, 14, 7630–7636

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-28 21:33

Apethie 发表于 2022-5-28 14:25
谢谢您，我是想画分子轨道杂化图（类似附件图片），因此想计算一下某两个原子之间的轨道大致分布，来做个 ...

实际体系里面，所有Mn的轨道和所有Se的轨道都会杂化，得到很多离域在整个体系上的分子轨道（也就是所谓的正则轨道canonical molecular orbital）。文献图上只画了一个Mn和一个Se是简略的画法，并不表示每个Mn只和一个Se发生轨道杂化。这个多看一些配体场理论的书就会知道，比如一个八面体配合物，金属是和6个配体的轨道同时杂化的。另外建议仔细看一下分子轨道理论方面的内容，有的课本在讲分子轨道理论的时候举的例子全是双原子分子，给人一种分子轨道总是两个原子参与杂化的错觉，但是那些讲得深一点的教材一定会告诉你，当原子数不止两个的时候，分子轨道是什么样的。然后你就会发现，几乎所有原子都参与杂化，一个分子有100个原子，可能每个轨道平均能有95个原子参与杂化。
所以直接算整个体系的分子轨道就行了，不能也不需要选两个原子。

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-28 22:15

sobereva 发表于 2022-5-28 21:05
至少我发帖的此时此刻，在大陆以外地区访问ORCA论坛是正常的。既可能你赶巧正好论坛有问题，要么就是姿势不 ...

明白啦，谢谢社长

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-28 22:21

wzkchem5 发表于 2022-5-28 21:33
实际体系里面，所有Mn的轨道和所有Se的轨道都会杂化，得到很多离域在整个体系上的分子轨道（也就是所谓的 ...

由于我的体系有一百多个原子，计算分子轨道的话输出数据应该会特别长，只能进行一定参考。还是说没有计算的必要，应该尝试从其他方面分析，谢谢您

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-5-29 00:36

Apethie 发表于 2022-5-28 15:21
由于我的体系有一百多个原子，计算分子轨道的话输出数据应该会特别长，只能进行一定参考。还是说没有计算 ...

输出数据长是正常的。找到前线轨道，分析每个原子的原子轨道对前线轨道的贡献，就行了。这个不需要去输出文件里找轨道系数，用Multiwfn等软件打开molden文件分析轨道系数也可以

作者
Author: sobereva 时间: 2022-5-29 01:38

Apethie 发表于 2022-5-28 22:21
由于我的体系有一百多个原子，计算分子轨道的话输出数据应该会特别长，只能进行一定参考。还是说没有计算 ...

Multiwfn载入ORCA的molden文件后，既可以输出你指定的轨道中各个原子的贡献，也可以计算你指定的原子对各个轨道的贡献，得到你感兴趣的信息很容易
看
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-29 12:53

wzkchem5 发表于 2022-5-29 00:36
输出数据长是正常的。找到前线轨道，分析每个原子的原子轨道对前线轨道的贡献，就行了。这个不需要去输出 ...

哇，明白了，谢谢您

作者
Author: Apethie 时间: 2022-5-29 12:53

sobereva 发表于 2022-5-29 01:38
Multiwfn载入ORCA的molden文件后，既可以输出你指定的轨道中各个原子的贡献，也可以计算你指定的原子对各 ...

嗯嗯，明白啦，谢谢社长

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