计算化学公社

标题: 请教一下制作IRI平面填色图时如何调整分子朝向变成案例中的垂直方式 [打印本页]

作者
Author:
食无鱼出无车    时间: 2022-5-28 23:54
标题: 请教一下制作IRI平面填色图时如何调整分子朝向变成案例中的垂直方式
      我在做一个分子的IRI平面填色图时,按照sobereva老师博文中的方法最后显示为图a,感觉太别扭了,想请教一下,能否在Multiwfn中调整分子结构朝向变成图b类似博文中案例的样子?之前画的一个类似结构的分子IRI平面填色图是和博文中的案例一样是垂直朝向,另外,我用GView查看了一下opt优化好的分子结构图,发现分子显示的结构朝向就是水平方向(图c)不是垂直方向(图d),是不是需要gaussian重新调整结构再计算?


作者
Author:
sobereva    时间: 2022-5-29 01:10
Multiwfn绘制平面图的功能已经支持对绘制内容平移和旋转
http://bbs.keinsci.com/thread-11037-1-1.html
作者
Author:
食无鱼出无车    时间: 2022-5-29 12:24
好的,谢谢sobereva老师。
作者
Author:
食无鱼出无车    时间: 2022-5-30 17:11
请教sobereva老师,按照您博文中的方法,将图b旋转成图a接近水平方向(或者图a转图b),从图中估算四元环中心位置应该不变,旋转6一定角度即可,但是在Multiwfn中输入相应平移量和角度后,方向并没有旋转,我尝试了多种平移量和旋转角度图像也没发生变化,是不是因为作图时选择的是1-XY plane方式而不是4-三个原子方式?我自己试了几中三个原子定义方式也没找到合适的显示效果,没弄明白。。。

作者
Author:
sobereva    时间: 2022-6-1 13:07
食无鱼出无车 发表于 2022-5-30 17:11
请教sobereva老师,按照您博文中的方法,将图b旋转成图a接近水平方向(或者图a转图b),从图中 ...

帖子里写明了
注意这个平移、旋转设定功能仅是对于以模式4、5方式定义作图平面而言的,以其它方式定义作图平面用这个选项无效。
如果你的回帖想引起我的注意,必须点击帖子下面的回复按钮
作者
Author:
食无鱼出无车    时间: 2022-6-1 15:06
sobereva 发表于 2022-6-1 13:07
帖子里写明了
如果你的回帖想引起我的注意,必须点击帖子下面的回复按钮


好的,sobereva老师,我理解错成是主功能里面的4了




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3