计算化学公社
标题:
求助compass力场Cu2+ LJ参数
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作者Author:
demihhh
时间:
2022-5-31 05:39
标题:
求助compass力场Cu2+ LJ参数
各位前辈好,
我想用cu2+做metal-ligand coordination的模拟,ligand和polymer是用的pcff力场,但是pcff没有cu2+的lj参数,搜索了一下发现貌似只有compass有铜离子的9-6 lj参数,但是我没有ms的license,托朋友看了下,好像compass力场参数看不到,看了几个帖子也是这样,所以针对这个提出几个疑问:
1. 如果用ms compass生成参数,转化成lammps input以后, 有可能能看到参数吗?还是说parameter file也是encoded看不见
2. 如果我用amber力场里的12-6铜离子参数,自己做一个简单的fit得到9-6参数,可以吗?问了我的导师,他说因为我只是想模拟monatomic离子(没有bond和surface),所以可能可以?
查了很多文献都没找到9-6的铜离子参数,本人又不会做dft优化,特此请教各位前辈有没有什么建议,谢谢!
作者Author:
sobereva
时间:
2022-5-31 07:10
都没M$的license干嘛还用M$,算完了也发不了文章
用GROMACS、AMBER等程序都能很好地跑这种体系,不花钱速度还远远快得多
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