计算化学公社

标题: 安装PLUMED2.8 + GROMACS2022.1 打补丁的时候，找不到gromacs2022.1 [打印本页]

作者
Author: wangyiwen 时间: 2022-6-1 10:26
标题: 安装PLUMED2.8 + GROMACS2022.1 打补丁的时候，找不到gromacs2022.1
安装PLUMED2.8 + GROMACS2022.1 打补丁的时候，找不到gromacs2022.1，请问是操作有问题吗？

$plumed patch -p

作者
Author: ene 时间: 2022-6-1 14:19
v2.8.0里面没有gmx2022.1的补丁。现在的Git master里面已经有了，你要么用Git master要么等v2.8.1发布。

作者
Author: wangyiwen 时间: 2022-6-1 14:37

ene 发表于 2022-6-1 14:19
v2.8.0里面没有gmx2022.1的补丁。现在的Git master里面已经有了，你要么用Git master要么等v2.8.1发布。

好的，谢谢你

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-6-1 15:04
建议用2021.5

作者
Author: wangyiwen 时间: 2022-6-1 15:45

Entropy.S.I 发表于 2022-6-1 15:04
建议用2021.5

好的，我有一个问题，在安装 gromacs2022版打补丁能用2021.5吗？

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-6-1 17:05

wangyiwen 发表于 2022-6-1 15:45
好的，我有一个问题，在安装 gromacs2022版打补丁能用2021.5吗？

直接全用2021.5就行了，2022版似乎没什么让人兴奋的升级，况且初期版本还没有经过时间的检验。2021版大幅提升了FEP/TI模拟的性能，2021.5还针对Ampere架构GPU优化了性能，目前看来大的BUG已经没有了，可以长期使用

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-2 01:46
看清楚板块再发，GROMACS的问题发到量化版做什么，给移动了，下次将扣分处理

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“GROMACS2022.1 + PLUMED 2.8.0”改了，以后务必注意，下次将删帖+扣分处理。

作者
Author: HZW 时间: 2022-6-2 13:24

Entropy.S.I 发表于 2022-6-1 17:05
直接全用2021.5就行了，2022版似乎没什么让人兴奋的升级，况且初期版本还没有经过时间的检验。2021版大幅 ...

难怪colvars只提供GROMACS 2021.5-colvars和GROMACS 2020.7-colvars两个patch的版本

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)