计算化学公社
标题:
液滴偏离盒子中心问题
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作者Author:
961106
时间:
2022-6-9 17:18
标题:
液滴偏离盒子中心问题
老师您好,我是模拟一个盒子里水滴的蒸发过程,但是我发现用vmd看模拟轨迹时,总是发现液滴的轨迹会偏离盒子中心,用trjconv -center后轨迹震荡的更加厉害,请问老师有没有办法让液滴不偏离中心,或者有没有办法可以校正得到不偏离中心的轨迹文件,谢谢老师。
作者Author:
sobereva
时间:
2022-6-10 07:30
如果你的问题等同于让最大的水簇的中心位置始终在盒子中心,没有简单的办法实现。需要写脚本,对每帧做个簇分析,根据最大尺寸的簇的几何中心和盒子中心算出平移矢量,令整个体系平移
作者Author:
961106
时间:
2022-6-10 10:26
sobereva 发表于 2022-6-10 07:30
如果你的问题等同于让最大的水簇的中心位置始终在盒子中心,没有简单的办法实现。需要写脚本,对每帧做个簇 ...
谢谢老师
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