计算化学公社

标题: 求助CatMap学习问题 [打印本页]

作者
Author: 不明嚼栗子 时间: 2022-6-10 22:13
标题: 求助CatMap学习问题
各位老师同学，我照着CatMap网站 https://catmap.readthedocs.io/en/latest/tutorials/refining_a_microkinetic_model.html 上教程操作的时候，出现如下图的警告，我的数据和代码完全是从网站上复制过来的，没有动过，最后得到的图也和教程中给出的不大相同，请问大家这是什么原因啊_(:з」∠)_谢谢大家了！

作者
Author: 我静静等待 时间: 2022-6-15 10:04
你可以对比一下作者github上的教程代码，两者可能有所区别 https://github.com/SUNCAT-Center/catmap

作者
Author: 是小智哎 时间: 2023-12-8 09:02
请问你这个问题解决了嘛，我也遇到了这个问题

作者
Author: 123wo 时间: 2023-12-8 10:58
不要紧，兄弟，你把原始数据导出来，自己用origin去画图。这个实际还是正常收敛的对吧，结果是对的，就是画图画的不好。python output.py production_rate

作者
Author: 123wo 时间: 2023-12-8 11:00
我认为还有一种可能是这些地方不收敛，不管怎么说先把原始数据导出来自己作图看看吧

作者
Author: 123wo 时间: 2023-12-8 11:02
我当时是安装的catmap 0.3.0 版本的python用的是python2.7.18版本，这个安装出来可能会好用的多。比0.3.1和python3,多尝试吧

作者
Author: 123wo 时间: 2023-12-8 11:04
补充：graphviz-2.46.1 ，ase-3.16.0 ，numpy-1.11.1，scipy-1.2.3 ，matplotlib-2.1.1

作者
Author: 2572094680 时间: 2023-12-19 15:38
求助，怎么把原始数据导出来啊

作者
Author: 哈库那摩塔塔 时间: 2024-4-29 16:13

2572094680 发表于 2023-12-19 15:38
求助，怎么把原始数据导出来啊

https://catmap.readthedocs.io/en ... matting_output.html

作者
Author: CHLllooll 时间: 2024-5-18 20:01

哈库那摩塔塔发表于 2024-4-29 16:13
https://catmap.readthedocs.io/en/latest/topics/accessing_reformatting_output.html

请问前辈把数据导出来之后，origin里边画图，那个颜色要选什么样的才能和catmap输出的颜色差不多呢

作者
Author: angelsu 时间: 2024-6-29 18:13
github上有对这个问题的讨论，之前试了可以解决

https://github.com/SUNCAT-Center/catmap/issues/137

作者
Author: CHLllooll 时间: 2024-7-16 10:34

123wo 发表于 2023-12-8 11:04
补充：graphviz-2.46.1 ，ase-3.16.0 ，numpy-1.11.1，scipy-1.2.3 ，matplotlib-2.1.1

您好，请问把原始数据导出来之后在origin里边选择什么样的颜色才能和这个原始输出的色号类似呢

作者
Author: 123wo 时间: 2024-7-16 19:41

CHLllooll 发表于 2024-7-16 10:34
您好，请问把原始数据导出来之后在origin里边选择什么样的颜色才能和这个原始输出的色号类似呢

我都是不和catmap的类似的，感觉比较暗淡

作者
Author: CHLllooll 时间: 2024-7-16 22:21

123wo 发表于 2024-7-16 19:41
我都是不和catmap的类似的，感觉比较暗淡

哦哦好的好的，我之前在一些文章里看过用导出的数据自己画图的，那些颜色和catmap差的挺大而且感觉不太好看；您知道像这类文章里他们那些活性图是咋画的吗？
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/ta/d4ta00710g
这是文章链接，在回复里好像发不了图片，还望见谅

作者
Author: 123wo 时间: 2024-7-17 11:14

CHLllooll 发表于 2024-7-16 22:21
哦哦好的好的，我之前在一些文章里看过用导出的数据自己画图的，那些颜色和catmap差的挺大而且感觉不太好 ...

我有一个配色方案文件和它差不读，稍等哈

作者
Author: 123wo 时间: 2024-8-2 18:11
@CHLllooll

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