计算化学公社

标题: 求助关于zeo++使用问题 [打印本页]

作者
Author: fdy哈哈哈 时间: 2022-6-15 00:14
标题: 求助关于zeo++使用问题
请教各位老师，我想通过zeo++来计算晶体的孔径分布等信息，我在VM中用centos7成功过编译了这款软件，在执行的时候也是按照阳老师这篇帖子来的
（Zeo++: 多孔材料孔结构性质的高通量分析软件 (qq.com)），但是却提示fail to open ***.cif，请各位老师指教。

作者
Author: thor 时间: 2022-6-27 13:09
路径不对吧

作者
Author: naoki 时间: 2022-6-27 13:16
你要在有cif文件的路径下执行

作者
Author: fdy哈哈哈 时间: 2022-7-5 16:36

naoki 发表于 2022-6-27 13:16
你要在有cif文件的路径下执行

已经解决了，感谢回答

作者
Author: jjb 时间: 2023-2-28 09:03
您好，请问您使用过Zeo++做大规模计算吗

作者
Author: fdy哈哈哈 时间: 2023-2-28 09:48

jjb 发表于 2023-2-28 09:03
您好，请问您使用过Zeo++做大规模计算吗

没有大规模，就是简单计算晶胞的孔结构数据

作者
Author: jjb 时间: 2023-2-28 10:28

fdy哈哈哈发表于 2023-2-28 09:48
没有大规模，就是简单计算晶胞的孔结构数据

好的，谢谢

作者
Author: MOFs的小奴隶 时间: 2023-4-12 10:03
同学你好，请问一下Zeo++这个软件怎么下载运行呀？我搞了好久也没搞懂如何下载使用，我也是想和你一样简单计算一下晶胞的结构性质。谢谢！！

作者
Author: John_Tao 时间: 2023-4-12 11:33

MOFs的小奴隶发表于 2023-4-12 10:03
同学你好，请问一下Zeo++这个软件怎么下载运行呀？我搞了好久也没搞懂如何下载使用，我也是想和你一样简单 ...

官网下载
http://www.zeoplusplus.org/download.html
里面有详细安装运行教程

作者
Author: MOFs的小奴隶 时间: 2023-4-23 20:12

John_Tao 发表于 2023-4-12 11:33
官网下载
http://www.zeoplusplus.org/download.html
里面有详细安装运行教程

感谢感谢，解决啦。

作者
Author: luogaoyang123 时间: 2023-7-4 00:54

fdy哈哈哈发表于 2023-2-28 09:48
没有大规模，就是简单计算晶胞的孔结构数据

请问只能计算晶体结构吗？无定形聚合物结构可以吗？

作者
Author: John_Tao 时间: 2023-7-31 17:57

luogaoyang123 发表于 2023-7-4 00:54
请问只能计算晶体结构吗？无定形聚合物结构可以吗？

只要有结构文件理论上应该都是可以的

作者
Author: honest 时间: 2023-9-26 14:49

jjb 发表于 2023-2-28 09:03
您好，请问您使用过Zeo++做大规模计算吗

github上面有Python脚本

作者
Author: 1853234478 时间: 2023-10-12 16:24

honest 发表于 2023-9-26 14:49
github上面有Python脚本

请问可以发一下链接吗

作者
Author: 张逸青 时间: 2023-10-21 20:07

fdy哈哈哈发表于 2022-7-5 16:36
已经解决了，感谢回答

你好，麻烦问一下怎么解决的呢，我也遇到同样的问题

作者
Author: MOF_ML 时间: 2023-11-20 15:17

MOFs的小奴隶发表于 2023-4-12 10:03
同学你好，请问一下Zeo++这个软件怎么下载运行呀？我搞了好久也没搞懂如何下载使用，我也是想和你一样简单 ...

我也是做MOF的理论计算的，zeo++的安装不是很懂，请问是怎么安装的呢？研究了好久还是不会。。

作者
Author: MOFs的小奴隶 时间: 2023-11-28 16:14

MOF_ML 发表于 2023-11-20 15:17
我也是做MOF的理论计算的，zeo++的安装不是很懂，请问是怎么安装的呢？研究了好久还是不会。。

Linux环境
1.解压软件包（此步之前将下载的软件包拖拽至最顶层目录内，即输入命令$cd ~之后的层目录中）
$tar -zxvf zeo++-0.3.tar.gz
2.编译Voro++库
$cd zeo++-0.3/voro++/src
$make
3.编译Zeo++代码
$cd ../..
$make
4.完成编译过程后，在zeo++-0.3的层目录下生成名为network的文件，此即为zeo++的可执行文件，可将其复制于方便使用的新建层目录下。

作者
Author: liyuqing 时间: 2024-8-22 17:18
请问zeo++大概能算多大体系的，我想算一下网络的，大概十几万个原子可以算吗

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