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标题: 采用过渡态跑CH3与CO2的BOMD，结果是否正确 [打印本页]

作者
Author: 18392667184 时间: 2022-6-15 16:47
标题: 采用过渡态跑CH3与CO2的BOMD，结果是否正确
请问各位老师，计算CH3与CO2的BOMD时，先进行了柔性扫描，找到了TS结构，然后进行IRC验证，如下图：
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irc产物端如下：
(, 下载次数 Times of downloads: 16)
然后取了过渡态结构跑BOMD,当速度取到28345742469485时，两分子间不反应，有排斥现象。因此将速度增大十倍，有如图结果：
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结果更像是速度过大，分子被撞散后，又重新结合。并没有出现IRC产物端的结构。
问：此BOMD结果合理吗？如果不合理，应该怎么调整。谢谢。BOMD输入输出，IRC输出结果见附件。 (, 下载次数 Times of downloads: 5) (, 下载次数 Times of downloads: 30) (, 下载次数 Times of downloads: 28)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-6-15 20:38
重复跑很多次看看。从过渡态开始跑MD，有一定概率是往反应物一侧跑的，并不必然是往产物一侧跑的，所以可能需要跑很多次、每次用不同大小和方向的初始速度，才能跑出生成产物的轨迹。

作者
Author: 18392667184 时间: 2022-6-15 22:08

wzkchem5 发表于 2022-6-15 20:38
重复跑很多次看看。从过渡态开始跑MD，有一定概率是往反应物一侧跑的，并不必然是往产物一侧跑的，所以可能 ...

好的我试试谢谢

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