计算化学公社

标题: VMD脚本计算数密度分布问题 [打印本页]

作者
Author: 961106 时间: 2022-6-17 11:13
标题: VMD脚本计算数密度分布问题
老师您好我用了您讲义上的脚本计算液滴的径向数密度分布，因为我的体系不是正好在中心，所以我自己设定了cen ken ten 三个值的坐标，但是却发现运行后出来的数据都是0，请问老师这是因为什么呢，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-17 16:05
这种问题，在脚本里加上puts输出中间变量，反复调试自然就明白了

cen ken ten 的数值大得离谱，确认到底对不对

作者
Author: 961106 时间: 2022-6-17 16:54

sobereva 发表于 2022-6-17 16:05
这种问题，在脚本里加上puts输出中间变量，反复调试自然就明白了

cen ken ten 的数值大得离谱，确认到底 ...

是对的老师，因为我的盒子是999.99nm边长的

作者
Author: 五月雨 时间: 2023-3-3 17:45

961106 发表于 2022-6-17 16:54
是对的老师，因为我的盒子是999.99nm边长的

请问楼主是怎么跑起来这么大的盒子的，我模拟的时候盒子直径大于100nm就会崩溃

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