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标题: 用PSI4进行能量分解报错 [打印本页]

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Chela    时间: 2022-6-18 12:33
标题: 用PSI4进行能量分解报错
各位老师好,本人根据sob老师的贴子 http://sobereva.com/526 使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算,在虚拟机安装了PSI4程序(Psi4conda-1.3.2-py36-Linux-x86_64)并成功重复出 水-氨气二聚体的SAPT的计算过程。之后对自己的环糊精体系进行计算时报错。参考其他同门的帖子更改了输入文件的内存及将堆栈大小设置成无限制,仍然出现报错问题(见图片)。现将输入文件和输入文件上传,请各位老师指教,感谢!
另:体系有149个原子,若真是因为体系太大无法利用PIS4进行能量分解,那对大体系的能量分解的定量分析方法除了使用Multiwfn做基于分子力场的能量分解分析外,还有什么方法?
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zjxitcc    时间: 2022-6-18 13:11
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-6-18 13:19 编辑

(1)就本帖而言,我看你算的是SAPT0,这对149原子没有压力。你把输入文件内存再加大(如果你机器还有剩余内存的话)
(2)PSI4已经到1.6版本了,不要用1.3.2那么老的版本,所有版本都在这里可以下载http://vergil.chemistry.gatech.edu/psicode-download/
(3)还有很多其他的能量分解,例如GKS-EDA,看我写过的教程《GKS-EDA计算简介》,这是在DFT级别下的能量分解,149原子没有压力。

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Chela    时间: 2022-6-18 15:46
zjxitcc 发表于 2022-6-18 13:11
(1)就本帖而言,我看你算的是SAPT0,这对149原子没有压力。你把输入文件内存再加大(如果你机器还有剩余 ...

老师,1、加大输入文件内存的前提是我虚拟机的内存足够大是吗?如果虚拟机内存不够就算加大输入文件的内存也会报错?
2、我重新装最新版本的PSI4试试;
3、谢谢老师!
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zjxitcc    时间: 2022-6-18 15:50
Chela 发表于 2022-6-18 15:46
老师,1、加大输入文件内存的前提是我虚拟机的内存足够大是吗?如果虚拟机内存不够就算加大输入文件的内 ...

1. 当然。小明只有100元,你非要写200元,那当然不行
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Chela    时间: 2022-6-18 19:06
zjxitcc 发表于 2022-6-18 15:50
1. 当然。小明只有100元,你非要写200元,那当然不行

谢谢老师,查明原因了,是我的物理机内存不够。
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mapleprinciple    时间: 2022-7-13 11:45
Chela 发表于 2022-6-18 19:06
谢谢老师,查明原因了,是我的物理机内存不够。

我也出现相同的问题,楼主能不能把解决方法说一下
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Chela    时间: 2022-7-15 15:46
mapleprinciple 发表于 2022-7-13 11:45
我也出现相同的问题,楼主能不能把解决方法说一下

用自己的电脑没办法吧这个,除非在超算上算




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