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标题: 求助MacOS版ORCA并行计算报错问题 [打印本页]

作者
Author: BLL130 时间: 2022-6-19 17:47
标题: 求助MacOS版ORCA并行计算报错问题
您好，我的ORCA版本是5.0.3，使用了对应的Open MPI 4.1.1版本。Open MPI的编译和安装正常结束，但在进行并行计算的时候报错（串行计算无问题）。环境变量设置如下： (, 下载次数 Times of downloads: 20)
通过which mpirun、mpirun --version检查了一下Open MPI的安装，没有问题。同时按照之前论坛里一些讨论的方法检查了gfortran、gcc的版本，同时使用echo检查了一下当前的环境变量，如下：
(, 下载次数 Times of downloads: 21)
然而运行ORCA的时候报错如下：
(, 下载次数 Times of downloads: 26)
发现程序根本没有在应该寻找“libmpi.40.dylib”的目录（即/Users/weida_feng/openmpi411/lib，此目录已加入环境变量）下去寻找此文件，因此提示找不到该文件。请问这种情况要如何解决呢？感谢您的解答！

作者
Author: abin 时间: 2022-6-19 19:00
ORCA针对x86平台。

你的苹果电脑，是Apple silicon ，也就是ARM64架构。

一个简单的方案是，
安装x86的brew，并使用homebrew安装所需要的所有相关的x86库文件。

然后，就能用了。

总之，所有相关的组件，都使用x86就可以了。

仅供参考。
自己动手吧。

祝好。
苹果会自动帮您转换x86的二进制文件。

作者
Author: BLL130 时间: 2022-6-19 19:15

abin 发表于 2022-6-19 19:00
ORCA针对x86平台。

你的苹果电脑，是Apple silicon ，也就是ARM64架构。

感谢您的回复！我最近研究研究。

作者
Author: mizu-bai 时间: 2022-6-19 19:27
可以试试通过 arm 版本的 homebrew 下载 openmpi，相比自己编译能少处理点依赖问题。这边是 Intel Mac 使用 ORCA 5.0.3，openmpi 使用 homebrew 安装的 4.1.4 版，也能正常运行，似乎对 openmpi 的版本要求没有太死。

作者
Author: BLL130 时间: 2022-6-19 21:05

mizu-bai 发表于 2022-6-19 19:27
可以试试通过 arm 版本的 homebrew 下载 openmpi，相比自己编译能少处理点依赖问题。这边是 Intel Mac 使用 ...

感谢，问题已解决。

作者
Author: BLL130 时间: 2022-6-19 21:10
本帖最后由 BLL130 于 2022-6-19 21:15 编辑

问题已解决，解决方式如下：

ORCA网站上现在已经有支持ARM64的版本可以下载了，M1芯片的MacBook下载的时候选择带“Arm64”字样的即可，我选的是“ORCA 5.0.3, MacOS X, Arm64(Accelerate), .tar.xz Archive”。之后Open MPI可以不自行编译，我是直接命令行输入的“brew install openmpi”即自动下载了Arm64版的Open MPI。版本为4.1.4，但是ORCA 5.0.3可以正常运行。
之后最关键的一步是将自动下载的位于/opt/homebrew/Cellar/open-mpi/4.1.4/的文件移至/usr/local/下，不知道为甚么ORCA不能识别/opt/下的Open MPI，我用的命令如下：
sudo cp -r /opt/homebrew/Cellar/open-mpi/4.1.4/bin/ /usr/local/bin/
sudo cp -r /opt/homebrew/Cellar/open-mpi/4.1.4/lib/ /usr/local/lib/
随后就可以正常运行了，不知道这样会不会有什么隐患，可能也是歪打正着

。

作者
Author: mizu-bai 时间: 2022-6-19 21:21

BLL130 发表于 2022-6-19 21:10
问题已解决，解决方式如下：

ORCA网站上现在已经有支持ARM64的版本可以下载了，M1芯片的MacBook下载的时 ...

可以直接软链接 ln -s 过去，这样更少占空间

作者
Author: mizu-bai 时间: 2022-6-19 21:22

BLL130 发表于 2022-6-19 21:10
问题已解决，解决方式如下：

ORCA网站上现在已经有支持ARM64的版本可以下载了，M1芯片的MacBook下载的时 ...

也可能是 /opt 下的 homebrew arm 路径没有添加到环境变量里，可以再试试排查一下

作者
Author: bluewhale 时间: 2022-6-19 21:32
在macOS下，变量名有变化：
export DYLD_LIBRARY_PATH=${OPENMPI_LIB}:${DYLD_LIBRARY_PATH}

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