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标题: 请问gromacs计算的径向分布函数是所有帧的平均值吗？ [打印本页]

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-22 00:47
标题: 请问gromacs计算的径向分布函数是所有帧的平均值吗？
本帖最后由 UTM 于 2022-6-22 00:49 编辑

如题，rdf计算出来的是所有帧的平均值还是最后一帧的值？以及rdf曲线和x轴围成的面积是否应该是1？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-22 01:36
gmx rdf默认算所有帧平均值
积分面积没有这种关系，自己看rdf的定义便知

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-22 01:59

sobereva 发表于 2022-6-22 01:36
gmx rdf默认算所有帧平均值
积分面积没有这种关系，自己看rdf的定义便知

好的，谢谢社长

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-22 16:28

sobereva 发表于 2022-6-22 01:36
gmx rdf默认算所有帧平均值
积分面积没有这种关系，自己看rdf的定义便知

请问sob老师，如果我选了多个原子计算rdf那计算结果是多个原子的g(r)的平均值吗？即计算所选每个原子r和r+dr的球壳处b原子的g(r)值求平均吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-23 00:20

UTM 发表于 2022-6-22 16:28
请问sob老师，如果我选了多个原子计算rdf那计算结果是多个原子的g(r)的平均值吗？即计算所选每个原子r和r ...

不知道你说的b原子是什么程序对选择的组里每个原子都计算rdf曲线，最后取平均

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-23 02:02

sobereva 发表于 2022-6-23 00:20
不知道你说的b原子是什么程序对选择的组里每个原子都计算rdf曲线，最后取平均

好的，明白了，谢谢社长。

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