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标题: 求助冰纳米线nvt模拟总是有缺陷 [打印本页]

作者
Author: gkg 时间: 2022-6-23 10:21
标题: 求助冰纳米线nvt模拟总是有缺陷
我做了一个全周期的截面为六边形的冰纳米线模型，pbc 盒子如图1和2所示。我想先用nvt来平衡一下，但是nvt之后总是在内部有些原子会乱跑，如图3.我是用一个截面为矩形的冰模型裁剪成六边形截面的，用这个矩形截面的模型跑nvt结构还是完好的如图四。而且我裁剪的模型已经检查过了，内部没有原子的空缺。而且我发现这些缺陷总是出现在斜的这个方向，调整（微调）pbc盒子的长度，这些缺陷会变少或者变多，但也是达不到完好的结构。这个问题卡了好久了，渴望得到各位老师的解惑。非常感谢。
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作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-23 19:15
冻结氧原子坐标，跑个升温-降温的退火，使得氢的朝向有机会弛豫到比较理想的状态试试

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