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标题: 求助利用ORCA+Multiwfn生成小分子的RESP原子电荷的问题 [打印本页]

作者
Author: angelhunte 时间: 2022-6-23 13:57
标题: 求助利用ORCA+Multiwfn生成小分子的RESP原子电荷的问题

新手求助：

利用 ORCA+Multiwfn 生成小分子的 RESP 原子电荷

将Multiwfn目录下的examples\RESP\目录下的RESP_ORCA.sh拷到当前目录，使用chmod +x ./RESP_ORCA.sh给它增加可执行权限。把含有分子结构信息的文件也拷到当前目录，格式是mol2。然后运行下面的命令：

./RESP_ORCA.sh JZ4.mol2

结果：Net charge was not defined. Default to 0
Spin multiplicity was not defined. Default to 1
Solvent name was not defined. Default to water
./RESP_ORCA.sh: line 58: Multiwfn: command not found
awk: fatal: cannot open file `tmp.xyz' for reading (No such file or directory)
rm: cannot remove 'tmp.xyz': No such file or directory
Running optimization task via ORCA...
[file orca_tools/Tool-Misc/qccc2ic.cpp, line 640]: No atoms to convert in Cartesian2Internal

The optimization task has failed! Please check content of opt.out to find reason
The script is terminated
rm: cannot remove 'opt_*': No such file or directory

已经在环境变量path中添加路径，为什么还出现
Multiwfn: command not found？

作者
Author: 牧生 时间: 2022-6-23 14:21
你有没有打开RESP_ORCA.sh这个脚本，把这两行红色改成实际路径
#Set actual paths of ORCA and orca_2mkl utility here
ORCA="/sob/orca503/orca"
orca_2mkl="/sob/orca503/orca_2mkl"

作者
Author: angelhunte 时间: 2022-6-23 14:24

牧生发表于 2022-6-23 14:21
你有没有打开RESP_ORCA.sh这个脚本，把这两行红色改成实际路径
#Set actual paths of ORCA and orca_2mkl ...

ORCA="E:/orca502/orca"
orca_2mkl="‪E:/orca502/orca_2mkl"

您好，我想问下，这是不是改的不对啊

作者
Author: 牧生 时间: 2022-6-23 14:34
本帖最后由牧生于 2022-6-23 14:35 编辑

angelhunte 发表于 2022-6-23 14:24
ORCA="E:/orca502/orca"
orca_2mkl="‪E:/orca502/orca_2mkl"

http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html

第一句话就划了重点，linux

之前笔者在以下文章中提供了三个Linux shell脚本

复制代码

作者
Author: angelhunte 时间: 2022-6-23 14:49

牧生发表于 2022-6-23 14:34
http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html

第一句话就划了重点，linux

知道了，谢谢~

作者
Author: panernie 时间: 2022-6-23 15:42

angelhunte 发表于 2022-6-23 14:49
知道了，谢谢~

装个cmder或者wsl，windows系统也可以

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-23 19:04
看Multiwfn手册2.1.2节了解怎么在Linux里装Multiwfn

在cmder提供的Bash环境里调用windows版的ORCA和Multiwfn也可以，前提是相应可执行文件路径都写对

作者
Author: yangqian 时间: 2024-10-17 10:40

牧生发表于 2022-6-23 14:21
你有没有打开RESP_ORCA.sh这个脚本，把这两行红色改成实际路径
#Set actual paths of ORCA and orca_2mkl ...

老师，您好，我在用RESP方法计算电荷时，RESP_orca.sh的路径也改了，系统也是linux系统，但还是出现了和贴主一样的问题，Multiwfn和ORCA都可以正常使用，请问有什么办法可以解决？

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