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标题: 用MS中GULP模块做300个原子体系MD计算,算完之后未响应,是配置不够还是设置问题 [打印本页]

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zdc    时间: 2022-6-25 16:45
标题: 用MS中GULP模块做300个原子体系MD计算,算完之后未响应,是配置不够还是设置问题
本帖最后由 zdc 于 2022-6-28 15:11 编辑

本人为分子模拟计算初学者,想用MS计算聚四氟乙烯-[CF2CF2]-n的热解反应,搭建了10条聚合度为10的聚四氟乙烯模型(320原子),用GULP模块进行MD计算,算完之后MS就卡死未响应,再次打开也会未响应,请问是电脑的配置已经不够计算这么大体系了吗,还是所建模型以及运算设置的问题呢?

模型搭建及计算过程:
1、搭建的模型初始密度设置为1.1g/cm3,然后用Forcite模块进行结构优化,退火,NVT下Dynamics跑了1000ps,NPT下Dynamics跑了1000ps,此时体系密度达到1.9g/cm3。这部分的力场均选择COMPASS
2、之后用GULP模块的Dynamics跑了1000ps,温度设置为1500K,Time step为0.1fs,力场选择ReaxFF6.0。大概跑了2天才计算完。

问题:
1、最后用GULP的Dynamics计算总是计算失败,并提示:ERROR : charge solution failed in setreaxffQiter,最后我把分子链设置成5才能正常计算,请问是什么原因?
2、算完之后再点击界面任何地方都会未响应,关闭程序再打开这个项目也会未响应,请问是电脑配置不够这个体系的计算吗,还是我的设置和模型有问题呢?

电脑配置:CPU i7 12700
                显卡  GTX1650         
                内存  32G
                1T SSD固态硬盘
                1T机械硬盘


优化后的模型: (, 下载次数 Times of downloads: 26)
程序未响应: (, 下载次数 Times of downloads: 30)


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zaozaojue    时间: 2023-2-15 19:07
您好 我也是初学者 在做MS的GULP热解 也遇到了相同问题 想加一下您的联系方式 一起讨论下
作者
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zaozaojue    时间: 2023-2-15 19:12
1.首先我觉得热解不能上来就直接在1500k下热解,你可以试试从300k下逐步温度梯度上升知道1500k
2.模拟时间会不会太长1000ps,我最近看的文献好像都是100ps左右
3.对于电脑配置我不是很了解,但是我在学校服务器上跑GULP也没有跑成功过,这个模块我没找到教程,也是自己不断摸索
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jsdx    时间: 2023-10-31 17:34
zaozaojue 发表于 2023-2-15 19:07
您好 我也是初学者 在做MS的GULP热解 也遇到了相同问题 想加一下您的联系方式 一起讨论下

您好,我也用GULP做聚合物的热解模拟,能加一下你联系方式吗
作者
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sonne    时间: 2025-11-10 14:35
zaozaojue 发表于 2023-2-15 19:07
您好 我也是初学者 在做MS的GULP热解 也遇到了相同问题 想加一下您的联系方式 一起讨论下

你好,请问这个问题您解决了吗?求解答谢谢

作者
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sonne    时间: 2025-11-10 14:36
你好,请问这个问题您解决了吗?求解答谢谢




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