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标题: 配合物晶体的自由区域绘制问题 [打印本页]

作者
Author: yyjyyj 时间: 2022-6-26 10:24
标题: 配合物晶体的自由区域绘制问题
请问一下，我在用Multiwfn和VMD结合去画cif文件的配合物晶体的自由区域，完全按照使用Multiwfn计算晶体结构中自由区域的体积、图形化展现自由区域 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)操作，结果观察发现有很多无序的分子，最重要的是，我配位的金属离子不见了。请问是什么原因，和怎么去解决呢？谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-26 19:51
不知道你说的无序分子指什么。Multiwfn不会修改结构文件，该有的原子不会自动失去。注意检查是否是显示方式设置的问题，或者看漏了。

“红色的氧和蓝色的氮都应该与金属原子连接！”这涉及到连接关系的判断，看下文
谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题
http://sobereva.com/534（http://bbs.keinsci.com/thread-16396-1-1.html）

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