计算化学公社

标题: 关于Molclus运行的问题 [打印本页]

作者
Author: Drunkenfairy 时间: 2022-6-27 20:28
标题: 关于Molclus运行的问题
请问我的Molclus在运行时，一直显示Gaussian正在计算，但是一直在算第一个构型（也就三个原子）。现在是搞不清是计算太慢还是我设置的问题，设置文件里面Gaussian路径我设置了，但是我没有设置电脑的环境变量。

作者
Author: snljty2 时间: 2022-6-27 20:59
明显settings.ini设置有错，屏幕提示很明显。认真看卢老师博文使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索里面的红字，特意用红字标出来的。

注意：如果是Windows版Gaussian，gaussian_path必须指向诸如g09.exe而不能是g09w.exe，因为后者只是前者的一个图形界面而已。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-27 20:59
又是这种老生常谈的问题，红字都不看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

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作者
Author: Drunkenfairy 时间: 2022-6-28 10:36

snljty2 发表于 2022-6-27 20:59
明显settings.ini设置有错，屏幕提示很明显。认真看卢老师博文使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜 ...

谢谢，改过来了

作者
Author: Drunkenfairy 时间: 2022-6-28 10:39

sobereva 发表于 2022-6-27 20:59
又是这种老生常谈的问题，红字都不看
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci. ...

谢谢sobereva老师，我都修改了，能调用高斯算，但是最后算成功了之后，isomers的文件还是空的

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-29 01:36

Drunkenfairy 发表于 2022-6-28 10:39
谢谢sobereva老师，我都修改了，能调用高斯算，但是最后算成功了之后，isomers的文件还是空的

molclus运行过程中在屏幕上给出非常详细的提示，仔细看屏幕上的内容判断，看不懂就把信息贴出来

作者
Author: Drunkenfairy 时间: 2022-6-29 10:44
好的，已经解决，是计算的问题

作者
Author: viycole 时间: 2022-10-12 08:36
想请教一下各位，在使用molclus长时间运行的时候，放在后台运行或者电脑息屏了的时候，程序计算完一个构象后不会自动跳转到下一个构象，需要用鼠标点一下软件的运行界面，才会跳转下一个构象计算。本来想着晚上让它自己跑7个构象的结构优化的，早上来看发现还在第一个，任务管理器显示CPU没有被占用，应该是算完了的，但是没有跳到第二个，于是我双击一下软件的最上面的白框，放大界面后，软件就自动跳转下一个了，上一个构象显示优化时间是35495s。
想问一下大家有没有遇到这种情况，如何解决不会自动跳转下一个构象的问题。谢谢！

作者
Author: viycole 时间: 2022-10-12 08:51
我这个分子，一般来说优化只要半个小时左右的。如下图所示，就是双击最上方的白边，作用是放大窗口，它就自动跳转第二个构象了，不然就一直卡在第一个。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-10-12 15:50

viycole 发表于 2022-10-12 08:36
想请教一下各位，在使用molclus长时间运行的时候，放在后台运行或者电脑息屏了的时候，程序计算完一个构象 ...

cmd窗口开启快速编辑模式时（win10默认开启），不要点击窗口里面，否则会进入编辑模式，导致计算中断

作者
Author: viycole 时间: 2022-10-12 16:03

sobereva 发表于 2022-10-12 15:50
cmd窗口开启快速编辑模式时（win10默认开启），不要点击窗口里面，否则会进入编辑模式，导致计算中断

好的谢谢老师，我注意一下看看情况！

作者
Author: laplacesuanzi 时间: 2022-10-18 07:57
怎么判断用molclus运行时，使用了CPU的几个核心数？Gaussian的default.rou里面已经设置了6个核心数。

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