计算化学公社

标题: 求助:freq计算出错,SCF一圈就结束了 [打印本页]

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慢慢来比较快    时间: 2022-6-27 22:28
标题: 求助:freq计算出错,SCF一圈就结束了
麻烦各位老师给看看,这个结构我是先进行的opt和freq进行计算,但是不知道为什么一到freq计算就错误停止,进行了单独的freq的计算以及调整、重新画结构重算也尝试了出现的错误相同。并且尝试换了机组也不大行。请求各路大神给予帮助,不胜感激。我将上传一个inp文件和out文件。

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wzkchem5    时间: 2022-6-27 22:49
确定高斯进程停止运行了吗,还是只是输出文件不再输出东西了?
如果是后者,不排除只是算得慢
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慢慢来比较快    时间: 2022-6-27 23:11
wzkchem5 发表于 2022-6-27 22:49
确定高斯进程停止运行了吗,还是只是输出文件不再输出东西了?
如果是后者,不排除只是算得慢

老师,我用的是Linux搭载的G16,PBS命令,然后每次算到freq之后,运行状态就会变成U,然后过两三分钟就停止了,用link查看是一个失败的任务。
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sobereva    时间: 2022-6-27 23:14
%mem给大再试
加上#P便于监控

如果不管多小的体系都有这问题,说明安装本身就有问题


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chands    时间: 2022-6-27 23:17
本帖最后由 chands 于 2022-6-27 23:21 编辑
慢慢来比较快 发表于 2022-6-27 23:11
老师,我用的是Linux搭载的G16,PBS命令,然后每次算到freq之后,运行状态就会变成U,然后过两三分钟就停 ...

你的系统报错会有一个报错文件(我的是slurm),你的out文件看不出问题。
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慢慢来比较快    时间: 2022-6-27 23:32
保存文件前面的信息我也不太会分析,貌似是因为内存不够导致任务终止?
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chands    时间: 2022-6-28 08:19
慢慢来比较快 发表于 2022-6-27 23:32
保存文件前面的信息我也不太会分析,貌似是因为内存不够导致任务终止?

最后一句:Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler.
正如楼上所说,内存不够。

Permission denied、Operation not permitted
应该是某个目录的权限不够,试一下用cd转到Gaussian所在目录,然后扩权,chmod 755 -R *




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