计算化学公社

标题: 请问使用Multiwfn计算分子体积可以用.mol2当做输入文件吗？ [打印本页]

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-28 15:09
标题: 请问使用Multiwfn计算分子体积可以用.mol2当做输入文件吗？
如题，请问在sob老师的这篇博文http://sobereva.com/102中提到的使用Multiwfn基于MT方法计算分子体积，输入文件可以是.mol2文件吗？（我分别使用几何优化和频率分析的.fch文件和.mol2文件当做输入文件都计算出了分子体积，但这两个值差距有点大）

作者
Author: snljty2 时间: 2022-6-28 15:35
本帖最后由 snljty2 于 2022-6-28 15:58 编辑

认真读第2段和第3段，写的不能更清楚了...

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-28 15:43

snljty2 发表于 2022-6-28 15:35
认真读第2段，写的不能更清楚了...

好的.........是我一目十行了，另外请问我用sob老师帖子里的蒙特卡罗方法和MT方法算的分子体积差距很大这是怎么回事？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-28 16:00

UTM 发表于 2022-6-28 15:43
好的.........是我一目十行了，另外请问我用sob老师帖子里的蒙特卡罗方法和MT方法算的分子体积差距很大这 ...

没细节没法说
MT方法的精度依赖于格点间距，MC方法的精度依赖于撒点数。而且MC方法既可以基于原子范德华球构造的范德华表面计算，也可以基于电子密度等值面定义的范德华表面计算。文章都写得超级清楚。

作者
Author: UTM 时间: 2022-6-28 16:40

sobereva 发表于 2022-6-28 16:00
没细节没法说
MT方法的精度依赖于格点间距，MC方法的精度依赖于撒点数。而且MC方法既可以基于原子范德华 ...

MT方法的话使用的输入文件是.fch文件，计算级别是b3lyp-d3/6-311g(d,p)，默认格点间距，结果是527.80立方埃；MC方法1（基于原子范德华球构造的范德华表面）输入文件是.mol2，i=10结果是378.77，i=20结果是373.00；MC方法2（基于电子密度等值面定义的范德华表面）输入文件和MT方法一样，i,x,k=10,0.001,1.7结果是544.74，MC方法2和MT方法算出来的值相差不大，为什么MC方法1差了那么多？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-6-29 01:24

UTM 发表于 2022-6-28 16:40
MT方法的话使用的输入文件是.fch文件，计算级别是b3lyp-d3/6-311g(d,p)，默认格点间距，结果是527.80立方 ...

本来两种方法定义的范德华表面就相差甚大，差别当然不可能不大
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Author: UTM 时间: 2022-6-29 10:42

sobereva 发表于 2022-6-29 01:24
本来两种方法定义的范德华表面就相差甚大，差别当然不可能不大

好的

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