计算化学公社

标题: 大佬们，不超100W，主要做手性反应机理研究，请问如下配置如何啊？ [打印本页]

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 12:03
标题: 大佬们，不超100W，主要做手性反应机理研究，请问如下配置如何啊？
本帖最后由 yinzihust 于 2022-7-5 13:51 编辑

我们主要是用高斯软件，做手性控制反应机理的研究，反应体系很大，200-300个原子或者更大，需要运算速度快，商家给的配置如下：

作者
Author: abin 时间: 2022-7-5 12:49
本帖最后由 abin 于 2022-7-5 14:36 编辑

四台双路6226R机器？
要发挥性能，需要4x 12 x 16GB内存条。
而非32条。

如果体系很大，
而且考虑多机器并行算一个任务的话，
需要升级网络。

当前的整体方案好业余呀！

作者
Author: 刘恪立 时间: 2022-7-5 13:21
预算不超过100w吗，主要是用那些软件，需不需要上GPU卡呢

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 13:35

刘恪立发表于 2022-7-5 13:21
预算不超过100w吗，主要是用那些软件，需不需要上GPU卡呢

预算是不超过100W，主要用高斯软件，GPU是否需要，这个我还不太懂，

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 13:37

abin 发表于 2022-7-5 12:49
四台双路6226R机器？
要发挥性能，需要4x 12 x 16GB内存条。
而非32条。

谢谢您的答复，我不懂，但据说这里比较专业，就上来问问大佬们了，

作者
Author: 刘恪立 时间: 2022-7-5 13:58

yinzihust 发表于 2022-7-5 13:35
预算是不超过100W，主要用高斯软件，GPU是否需要，这个我还不太懂，

如果是100w预算，那完全可以配置更高的设备了。

管理节点可以使用8375c双路服务器，计算节点可以使用4个7702双路不带显卡的计算节点+2个7702双路带显卡A100显卡 80G显存作为GPU加速计算节点，整体价格在85万左右~

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-7-5 14:16
这么大金额是否走政采/招标？走招标和不走招标完全是两个方案

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2022-7-5 14:23

yinzihust 发表于 2022-7-5 13:35
预算是不超过100W，主要用高斯软件，GPU是否需要，这个我还不太懂，

Gaussian支持使用计算加速卡加速计算，但效率极低，性价比还不如纯CPU。如果只用Gaussian，完全没必要配GPU

作者
Author: abin 时间: 2022-7-5 14:39
本帖最后由 abin 于 2022-7-5 14:46 编辑

yinzihust 发表于 2022-7-5 13:37
谢谢您的答复，我不懂，但据说这里比较专业，就上来问问大佬们了，

更新一下.
以上针对题主描述使用Gaussian的场景.
请查阅https://hpc4you.github.io页面, 使用
Intra-node Local-I/O Cluster配置框架即可.

如果喜欢6系列处理器,
可以使用6258R, 这个和8280L同参数, 只是更加便宜, 只能双路而已.
或者使用6248R, 是24核心的.

内存通道开满(而非内存条插满).

其他细节, 请仔细看图片上的备注描述.

主要使用高斯, 又不考虑多机器并行计算的话, 不需要升级网络.

如果担心兼容性问题, 选用AMD要留心哦.

主要负载Gaussian的集群系统,
管理和存储放一个机器, 做好数据自动备份, 一个普通的8核心机器, 都轻松无压力.

用新一代的处理器,
意味着更佳的性能.
但是更多的金钱来支撑.

所以, 你的问题应该简化为, 主要使用高斯, 限定节点内并行, 预计需要几台机器, 做到多少核心, 每一个核心预计配置多少容量内存, 需要多大的存储空间.
然后问题就比较好办了.

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 15:57

Entropy.S.I 发表于 2022-7-5 14:16
这么大金额是否走政采/招标？走招标和不走招标完全是两个方案

招标方式

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 16:08

Entropy.S.I 发表于 2022-7-5 14:23
Gaussian支持使用计算加速卡加速计算，但效率极低，性价比还不如纯CPU。如果只用Gaussian，完全没必要配G ...

好的，谢谢您！

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 16:29

abin 发表于 2022-7-5 14:39
更新一下.
以上针对题主描述使用Gaussian的场景.
请查阅https://hpc4you.github.io页面, 使用

好的，我找经销商再优化一下配置方案，麻烦您了！谢谢

作者
Author: abin 时间: 2022-7-5 16:32

yinzihust 发表于 2022-7-5 16:29
好的，我找经销商再优化一下配置方案，麻烦您了！谢谢

硬件商家看不懂英文的话,
这里有中文的.
https://gitee.com/hpc4you/hpc

里面的PDF档案, 讲解更为详尽.
如有兴趣, 自行查看.

作者
Author: yinzihust 时间: 2022-7-5 17:38

abin 发表于 2022-7-5 16:32
硬件商家看不懂英文的话,
这里有中文的.
https://gitee.com/hpc4you/hpc

好专业啊，有点晕了，谢谢您，

作者
Author: beowulf 时间: 2022-7-6 09:01
机柜很小么？
为啥推荐2u四节点给你们。

你们的应用场景如果是吃频率多一点的话，上更高频（更热）的cpu。

作者
Author: gauss98 时间: 2022-7-7 10:29
又贵又不好用
业余

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