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标题: gromacs中log文件中这些DD后面的输出的含义是什么 [打印本页]

作者
Author: 吧唧爱吃糖 时间: 2022-7-5 21:45
标题: gromacs中log文件中这些DD后面的输出的含义是什么
请教一下各位关于gromacs中log文件中这些DD后面的输出的含义是什么那？

DD  load balancing is limited by minimum cell size in dimension X
DD  step 130899999  vol min/aver 0.498! load imb.: force  6.0%  pme mesh/force 1.147
         Step          Time
   130900000 130900.00000

Energies (kJ/mol)
      G96Bond    G96Angle Proper Dih.       LJ-14    Coulomb-14
2.27515e+02 1.06428e+03 1.11446e+02 2.95895e+02 -2.40924e+03
      LJ (SR) Coulomb (SR) Coul. recip.    Potential Kinetic En.
1.46205e+04 -1.05564e+05 5.11819e+02 -9.11419e+04 1.69742e+04
Total Energy  Conserved En. Temperature Pressure (bar) Constr. rmsd
-7.41678e+04 -1.11779e+05 2.49560e+02 1.28953e+03 1.81853e-07

DD  step 130999999  vol min/aver 0.629  load imb.: force  4.2%  pme mesh/force 1.169
         Step          Time
   131000000 131000.00000

Energies (kJ/mol)
      G96Bond    G96Angle Proper Dih.       LJ-14    Coulomb-14
2.65538e+02 1.15043e+03 1.03704e+02 2.77734e+02 -2.38905e+03
      LJ (SR) Coulomb (SR) Coul. recip.    Potential Kinetic En.
1.37728e+04 -1.04192e+05 5.48326e+02 -9.04628e+04 1.68364e+04
Total Energy  Conserved En. Temperature Pressure (bar) Constr. rmsd
-7.36264e+04 -1.11945e+05 2.47534e+02 4.70294e+02 1.69685e-07

DD  load balancing is limited by minimum cell size in dimension X
DD  step 130899999  vol min/aver 0.498! load imb.: force  6.0%  pme mesh/force 1.147
和
DD  step 130999999  vol min/aver 0.629  load imb.: force  4.2%  pme mesh/force 1.169有什么区别吗？
下面Energies项是代表的各项的平均值吗？

感谢各位

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-6 02:20
DD = domain decomposition

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哪来的什么平均值，平均什么
输出信息没有任何歧义

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