计算化学公社

标题: 求助计算三层C3N4的AIMD时层与层之间位移较大 [打印本页]

作者
Author:
ljc050512    时间: 2022-7-6 15:52
标题: 求助计算三层C3N4的AIMD时层与层之间位移较大
诸位老师好,最近我在用CP2K对g-C3N4进行AIMD模拟时,发现三层的C3N4模型中(请见下图)层与层之间位移较明显,不知道是什么原因,也不清楚怎么处理。
我是用Multiwfn产生的输入文件(见附件),使用PBE加了DFT-D3(BJ)校正,1 fs/步,初步模拟了5 ps。


作者
Author:
sobereva    时间: 2022-7-7 04:17
位移是必然的现象。石墨每层之间是位错的也是相同的本质,因为位错可以减小层间静电互斥。18碳环二聚体也是彼此位错的,可以用表面静电势互补来直观解释,见下文
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html

C3N4的电荷分布交替特征比石墨还显著得多,这种位错现象无疑会更明显。
另外,观看这种体系时应当用正交视角,不要用默认的透视,否则远处近处原子的排列关系看不清楚

另外,当前模拟的X、Y方向尺寸偏小,建议各扩一倍


作者
Author:
ljc050512    时间: 2022-7-7 08:32
sobereva 发表于 2022-7-7 04:17
位移是必然的现象。石墨每层之间是位错的也是相同的本质,因为位错可以减小层间静电互斥。18碳环二聚体也是 ...

十分感谢sob老师的解答!看完老师的解释,我能否这样理解:C3N4自身的性质决定了它在这个AIMD的模拟中就是会发生逐渐平移滑开的客观现象,不能通过外在设置进行人为干涉,也不应该人为干涉。
作者
Author:
sobereva    时间: 2022-7-8 05:14
ljc050512 发表于 2022-7-7 08:32
十分感谢sob老师的解答!看完老师的解释,我能否这样理解:C3N4自身的性质决定了它在这个AIMD的模拟中就 ...






欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3