计算化学公社
标题:
xtb限制性搜索构象出问题,没法冻结原子
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作者Author:
夜千
时间:
2022-7-7 13:49
标题:
xtb限制性搜索构象出问题,没法冻结原子
各位老师好,我利用xtb进行构象搜索,需固定60%以上原子,输入文件为
$md
temp= 400
time= 100.0
dump= 50.0
step= 1.0
hmass=1
shake=1
$fix
atoms:1-214,239
force constant=0
$end
其中,输出文件如下。下方的大体系就是我固定部分,但是一直在震荡,请问哪里写错了呢
作者Author:
CYQ@
时间:
2022-8-23 21:24
XTB好像跑md没法固定,优化可以固定,但是可以用强限制达到固定效果
作者Author:
WaterMirror
时间:
2024-11-13 21:32
CYQ@ 发表于 2022-8-23 21:24
XTB好像跑md没法固定,优化可以固定,但是可以用强限制达到固定效果
您好,请问什么叫强制限制呢?是fix关键词吗?这个跑MD就会自动失效呀好像。
作者Author:
低头问花花不语
时间:
2025-7-30 15:47
MD需要用constrian关键词,结构优化可以用fix
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