计算化学公社

标题: 如何一次性调整多个键长 [打印本页]

作者
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知黑守白    时间: 2022-7-7 19:53
标题: 如何一次性调整多个键长


如题,使用gview需要调整结构中的N-H键长,如何选中所有的N-H键,一并调整呢?

可能几十上百个,手动一个个调整慢,还可能会漏,gview能实现这种多键同时调整吗?

如果不能的话,用什么软件可以实现呢?

作者
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niobium    时间: 2022-7-7 20:26
为何要做这种操作呢?你不做结构优化?或者至少要优化氢吧
作者
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知黑守白    时间: 2022-7-8 00:02
niobium 发表于 2022-7-7 20:26
为何要做这种操作呢?你不做结构优化?或者至少要优化氢吧

您好,就是想借助一下gview处理结构,并非单纯的QM任务,后续可能要拿去MD或是做反应力场
作者
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sobereva    时间: 2022-7-8 04:19
这种做法没任何实际意义
本来所有N-H键的键长又不可能完全相同(除非体系有对称性)
如果想较快速自发调节H到较合适位置,一般应当冻结重原子对氢做半经验或GFN-xTB级别的优化




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