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标题: 自由基解离过程的柔性扫描问题 [打印本页]

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Author: qiqi7 时间: 2022-7-8 19:30
标题: 自由基解离过程的柔性扫描问题
本帖最后由 qiqi7 于 2022-7-8 19:30 编辑

各位老师好！我在研究CN+toluene反应体系的时候，通过过渡态搜索+IRC确认过渡态连接，计算级别为M06-2X-D3/6-311+G(d,p)，构造了如下势能面（略掉一些不关键路径）
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势能面的结果显示，该反应第一步为无势垒反应（如图共4个加成位点，加成势阱约40kcal/mol），后续再发生各种复杂反应。后续我预备将该势能面的结果放到主方程软件里求得该反应各通道的速率常数。通过调研，预备先测试使用VTST方法获得反应物到各个adduct的反应速率常数，此时对该加成过程进行了柔性扫描。但扫描过程中会出现CN从一个加成位点跑去另一个加成位点的问题，如图为ipso-adduct跑到o-adduct：
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请问如果我想获得该体系各个位点CN远离加成位点的柔性扫描曲线，该使用什么样的关键词？感谢各位老师！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-8 19:44
可能说明CN从ipso位异构化到o位没有能垒或者能垒极低。可以先优化ipso的产物，再反着扫描

作者
Author: qiqi7 时间: 2022-7-9 15:34

wzkchem5 发表于 2022-7-8 19:44
可能说明CN从ipso位异构化到o位没有能垒或者能垒极低。可以先优化ipso的产物，再反着扫描

不同位点加成产物之间的异构化的过渡态是存在的，未在图里标出，异构化的势垒在35kcal/mol作用，是很高的垒。您后一句话的意思是从远往近扫吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2022-7-9 16:46

qiqi7 发表于 2022-7-9 08:34
不同位点加成产物之间的异构化的过渡态是存在的，未在图里标出，异构化的势垒在35kcal/mol作用，是很高的 ...

我仔细看了一下，上一个帖子我搞错了。这里的主要问题在于，扫描C(ipso)-C(CN)键的时候，CN可以通过和C(o)成键来降低能量，所以你要研究的路径（C(ipso)-C(CN)键解离，且CN不和C(o)成键）不是能量最低的途径，所以做柔性扫描跑偏了也是正常的。但是你要研究的这个路径在限制分子为Cs对称性的情况下（也即强制让氰基不偏向任何一个邻位碳原子，从而让它不可能与任何一个C(o)成键），应该是能量最低的途径。所以可以考虑在限制Cs对称性的情况下扫描。扫描方向仍然是从短往长扫

作者
Author: qiqi7 时间: 2022-7-9 17:05

wzkchem5 发表于 2022-7-9 16:46
我仔细看了一下，上一个帖子我搞错了。这里的主要问题在于，扫描C(ipso)-C(CN)键的时候，CN可以通过和C(o ...

好的，我试试，谢谢老师

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