计算化学公社

标题: 高斯使用不了全部36个核心 [打印本页]

作者
Author: 康康SCU 时间: 2022-7-8 21:03
标题: 高斯使用不了全部36个核心
在用高斯16 A计算激发态时，运行的核心数会自动减少至24个，求助！
没有写内存限制，因为加了%mem后出现link died，只好删了；CPU是双路E5 2696 v3；
%nprocshared=36
%chk=D:\KJY\amideTDDFT1.chk
# CAM-b3lyp/6-311++g(d,p) TD(nstates=5) IOp(9/40=4)

截图如下

作者
Author: 康康SCU 时间: 2022-7-8 21:05
高斯里有行描述是 requested number of processors reduced to: 25 ShMem 1 Linda.

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2022-7-8 22:51
先排除：内存太少（默认只有800 MB）导致不够分，体系太小导致不用分。

作者
Author: yjb 时间: 2022-7-9 00:15
在默认设置里面把内存给多点，给80GB.

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-9 04:22
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

仔细把此文看了就没疑问了，而且也不会再做出用Windows版Gaussian上用几十个核并行这种事。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-9 04:23

康康SCU 发表于 2022-7-8 21:05
高斯里有行描述是 requested number of processors reduced to: 25 ShMem 1 Linda.

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

作者
Author: 康康SCU 时间: 2022-7-14 19:33

yjb 发表于 2022-7-9 00:15
在默认设置里面把内存给多点，给80GB.

嗯，设置了Default.Route文件将默认内存给到了100GB，重复了下还是只有不到一般的核心在跑，在学习用Linux计算了，谢谢。

作者
Author: 康康SCU 时间: 2022-7-14 19:37

sobereva 发表于 2022-7-9 04:22
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1 ...

谢谢老师，之前已经看过了，http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html这里建议用Linux跑，打算学习Linux系统高斯的使用。
不过http://bbs.keinsci.com/thread-7472-1-1.html这个帖子写了windows系统下高斯16的使用，是可以跑满的，就很奇怪。

作者
Author: 康康SCU 时间: 2022-7-14 19:38

liyuanhe211 发表于 2022-7-8 22:51
先排除：内存太少（默认只有800 MB）导致不够分，体系太小导致不用分。

Default.Route文件给了高斯默认100GB内存，发现只使用了2GB不到，打算学习下Linux再试试。

作者
Author: lanthanum 时间: 2022-8-3 14:10

康康SCU 发表于 2022-7-14 19:37
谢谢老师，之前已经看过了，http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html这里建议用Linux跑，打算学习L ...

按那个帖子重复不出来，楼主tjchkj也很久没上论坛了。
我的也跑不满，怀疑是openMP的事。
不管并行效率如何，即使写%nprocs=64，也只能用一个cpu的36核，另一个cpu闲着，这明显是有问题的。
请看私信，我们讨论一下这个问题。谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2022-8-11 07:37

lanthanum 发表于 2022-8-3 14:10
按那个帖子重复不出来，楼主tjchkj也很久没上论坛了。
我的也跑不满，怀疑是openMP的事。
不管并行效率 ...

Windows下的Gaussian就甭考虑了

Linux下如果也有那种问题，尝试调整%CPU，参考http://sobereva.com/392

作者
Author: paramecium86 时间: 2022-8-11 08:56

lanthanum 发表于 2022-8-3 14:10
按那个帖子重复不出来，楼主tjchkj也很久没上论坛了。
我的也跑不满，怀疑是openMP的事。
不管并行效率 ...

我自己尝试过。超过64线程的的双U平台（比如2* 2696v3 开了超线程后就是72线程），用高斯win版的时候无论怎么写nproc 都只能使用其中一个CPU。这个应该是win版的问题。如果再bios里吧超线程关掉，整个平台就只有36线程了，那再使用win版的高斯就可以正常调用2个CPU同时工作。不过效率也还很堪忧的。即使都用上双CPU，比如0397任务大概也只有LINUX下同核心数的1/3速度。

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