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标题: 环状结构计算的CDA电荷和NBO分析结果不一致,哪一个更可靠呢。 [打印本页]

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molx79    时间: 2016-4-20 17:06
标题: 环状结构计算的CDA电荷和NBO分析结果不一致,哪一个更可靠呢。
各位老师:目前计算环状结构的电荷转移,在学习了Sob老师的《使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图》之后,计算如下
  
在环状结构中每一个分子既是电子给体,也是电子供体。想搞明白片段直接的电子转移数。
Multiwfn3.3.9版本计算,过程如下:
1.     从三体复合物中截取片段1和片段2作为新复合物(1+2),再分别取片段1,片段2。目的计算在三体复合物中1和2之间的电荷转移。
2.     同理,计算三体复合物中2和3之间的电荷转移
3.     同理,计算三体复合物中1和3之间的电荷转移
结果如下:
1、 片段2向片段1转移了0.0174(ECDA结果)电子,片段1向片段3转移了0.0220(ECDA结果)个电子,则片段1的net charge为0.0046(缺电子)。
2、 片段3向片段2转移了0.0306(ECDA结果)电子,片段2向片段1转移了0.0174(ECDA结果)个电子,则片段2的net charge为-0.0132(富电子)。
3、 片段1向片段3转移了0.0220(ECDA结果)电子,片段3向片段2转移了0.0306(ECDA结果)个电子,则片段3的net charge为0.0086(缺电子)。
Result
1、 三体复合物的netcharge=0.0046+0.0086-0.0132=0 合理
2、NBO分析的NPA电荷为:片段1:0.0102  片段2:-0.0050,片段3:-0.0052
即:NBO分析和CDA(ECDA)结果不一致。
疑问:1、两者为什么结果不一致?为什么?哪一个结果更可靠。
      2、上述的分析过程是否合理?
恳求大师赐教。


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冰释之川    时间: 2016-4-20 18:17
我这里也有 ECDA和 NPA 分析结果有矛盾的 情况,同请教
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sobereva    时间: 2016-4-20 19:13
我没弄清楚你的情况,为什么分三个过程。Multiwfn做CDA可以定义无数个片段,如果目的是分析三聚体中各个片段间的转移,就直接在Multiwfn里做三个片段的CDA就完了,每一对片段间都能直接得到d,b,r。

如果你的目的是做ECDA,确实一次只能设两个片段,算你的体系时必须每次合并其中两个片段。

你的目的如果不是想研究片段之间转移的细节,而只是想研究转移以后每个片段带电荷的净值,就直接用原子电荷的计算方法来计算片段电荷即可。NPA、Hirshfeld、ADCH方法你可以都算算,如果有一致性的结论那最好。不用管ECDA,用处不大。
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冰释之川    时间: 2016-4-20 19:17
sobereva 发表于 2016-4-20 19:13
我没弄清楚你的情况,为什么分三个过程。Multiwfn做CDA可以定义无数个片段,如果目的是分析三聚体中各个片 ...

老师,也就是说,我如果考察 片段净电荷,优先选择NPA、ADCH等,即使和ECDA算出来的结果不一致(矛盾),也是 选择NPA的结果对吗?
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sobereva    时间: 2016-4-20 20:13
冰释之川 发表于 2016-4-20 19:17
老师,也就是说,我如果考察 片段净电荷,优先选择NPA、ADCH等,即使和ECDA算出来的结果不一致(矛盾), ...

恩。当前问题不管ECDA。
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molx79    时间: 2016-4-21 09:41
本帖最后由 molx79 于 2016-4-21 09:53 编辑
sobereva 发表于 2016-4-20 19:13
我没弄清楚你的情况,为什么分三个过程。Multiwfn做CDA可以定义无数个片段,如果目的是分析三聚体中各个片 ...

老师好:
     我是想,计算三聚体中各个片段的转移。根据你的启发我又重新整理计算了一下。您看思路是否正确:
第一步:1+2+3.out,  1.out,2.out,3.out(1个复合物,3个片段)。分别计算片段1和片段2的转移量(取值最后一行的 sum    d-b),片段2和片段3的转移量(最后一行的 sum    d-b),片段1和片段3的转移量(最后一行的 sum    d-b)。
最后的结果是:1的net charge 0.00544
                       2的net charge-0.00998
                       3的net charge 0.00454
和NBO不一致,但是和第一次处理的ECDA一致(缺电子和富电子一致,但是数值差别很大),在您的博文里提高讨论静电荷时ECDA给的数值可靠。
我的目标:用multiwfn计算出各个片段之间的转移,其结果得到静电荷又和NPA电荷一致。

老师:我的处理过程正确吗?
         或者想搞明白各个片段之间的电荷转移,应该怎么处理?
谢谢老师指点。


另外,做CDA时   看d           b        d - b值,目的是看哪个轨道的具体转移的量吗?直接从Sum:     120.000000    0.024018   -0.007636    0.031654   -0.099869  这一行看可以吗?

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sobereva    时间: 2016-4-21 10:05
molx79 发表于 2016-4-21 09:41
老师好:
     我是想,计算三聚体中各个片段的转移。根据你的启发我又重新整理计算了一下。您看思路是 ...


CDA的最主要目的还是具体分析轨道之间如何相互作用导致电荷转移,属于定性分析,定量考察净转移量的话不是非常可靠。定量的净转移量还是应当看原子电荷加和的片段电荷。
对当前情况,本身由于是弱相互作用,电子转移量就甚微,而且又牵扯到片段之间CDA结果的累加,再想让NPA和CDA的结果能很好对上,这很难做到。当然,建议也看看其它原子电荷计算方法,如果能和CDA对上那正好。
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molx79    时间: 2016-4-21 12:15
sobereva 发表于 2016-4-21 10:05
CDA的最主要目的还是具体分析轨道之间如何相互作用导致电荷转移,属于定性分析,定量考察净转移量的话 ...

感谢老师,继续探索,期待下次与您交流
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zhangyina    时间: 2017-4-19 22:25
为什么通过CDA计算的d-b 的结果是正的,但是ECDA的结果是负的,那么以哪个为标准?
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sobereva    时间: 2017-4-19 22:33
zhangyina 发表于 2017-4-19 22:25
为什么通过CDA计算的d-b 的结果是正的,但是ECDA的结果是负的,那么以哪个为标准?


首先确认是用的最新版本,后来的版本修正过一些CDA的bug
如果你要单纯考察电荷转移量和方向,以ECDA的为准。CDA的结果会把极化效应等效体现到d,b里(有的体系这个情况比较严重),导致不是真实反映转移的量。所以如果不是从轨道角度讨论转移细节,没必要管CDA。




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