计算化学公社
标题:
Multiwfn结合molden绘制电子密度曲线与cp2k输出的density.cube文件绘图结果有出入...
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作者Author:
nusiew
时间:
2022-7-10 21:43
标题:
Multiwfn结合molden绘制电子密度曲线与cp2k输出的density.cube文件绘图结果有出入...
大家晚上好,我的研究体系是Si熔体中掺杂少量P。基于cp2k输出的电子密度cube文件绘制的电子密度填色图及其等高线如左图所示,由填色图可以看出P-Si间的电子密度小于0.1,大于0.06。右图是基于cp2k输出的molden文件利用Multiwfn绘制的P-Si间的电子密度(molden文件格式已将电子赝势化并添加了晶格信息),发现最小值要大于0.1,请问与左图等高线结果为啥二者不一致呢?还有一个问题就是填色图中为啥Si,P原子的中心都是红色,因为是原子核没有电子的缘故吗?用Multiwfn绘制的为啥存在尖峰呢(图中没有显示,我给截取掉了),为啥不是中心也为0呢?谢谢大家!
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作者Author:
sobereva
时间:
2022-7-11 05:10
你用了赝势,CP2K导出的电子密度cube文件只展现价层电子,而你要求Multiwfn计算时考虑了内核电子,显然会不同
我专门有篇文章讨论了价层电子密度的独特价值:
http://www.whxb.pku.edu.cn/EN/10.3866/PKU.WHXB201709252
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