计算化学公社

标题: 关于RMSD 和RMSF 与刚性/柔性的问题 [打印本页]

作者
Author: azero 时间: 2022-7-12 20:55
标题: 关于RMSD 和RMSF 与刚性/柔性的问题
本帖最后由 azero 于 2022-7-12 20:56 编辑

投了一个酶分子热稳定性改造的文章。然后审稿人的意见这样的，
标红那句话的确是对的，RMSF和RMSD两个指标只能说明突变体与初始状态的偏离程度较小。
但是传统做酶热稳定性改造的MD套路都是这样的，
请教该如何修改或回复比较好（主要是标红那句的问题）。

作者
Author: 18217265596 时间: 2022-7-13 10:11
rmsd的周期波动和rmsf的绝对值能说明柔性

作者
Author: azero 时间: 2022-7-15 09:20

18217265596 发表于 2022-7-13 10:11
rmsd的周期波动和rmsf的绝对值能说明柔性

能不能再详细解释，还是不太明白T_T，谢谢

作者
Author: sylar 时间: 2022-7-15 11:14
他的意思是RMSD不能说明是否刚性，你只说lower RMSF means a more rigid structure我感觉没什么问题

作者
Author: azero 时间: 2022-7-15 17:15

sylar 发表于 2022-7-15 11:14
他的意思是RMSD不能说明是否刚性，你只说lower RMSF means a more rigid structure我感觉没什么问题

审稿人真是鸡蛋里挑骨头

作者
Author: xiaoruoqiu 时间: 2022-8-18 18:55

azero 发表于 2022-7-15 17:15
审稿人真是鸡蛋里挑骨头

审稿人说的没错

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)