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标题: 求助含镧系金属Gd的溶解自由能计算的基组选择 [打印本页]

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树独Comche    时间: 2022-7-13 20:59
标题: 求助含镧系金属Gd的溶解自由能计算的基组选择
sob老师,想请问一下,在算镧系金属Gd的180原子左右的配合物的溶解自由能时可用选用什么基组?我们根据您的http://sobereva.com/327这篇帖子考虑用M062X/6-31G*的水平计算。但由于6-31G*对镧系金属没有定义。又根据帖子中提到的“如果6-31G*对当前算的过渡金属没有定义的话,用其它恰当的赝势基组也可以,诸如SDD、Lanl2TZ(f)等”,我们考虑对其他原子用6-31G*而对Gd用SDD想问一下这样选择是否合适?或者有没有更优的一些计算水平?

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wzkchem5    时间: 2022-7-14 01:36
可以。此外注意对Gd以及任何带显著电荷、和溶剂之间有很强的氢键的基团做显式溶剂化,并且最好做构象搜索
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树独Comche    时间: 2022-7-14 10:14
wzkchem5 发表于 2022-7-14 01:36
可以。此外注意对Gd以及任何带显著电荷、和溶剂之间有很强的氢键的基团做显式溶剂化,并且最好做构象搜索

好的,谢谢您
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wangzh    时间: 2023-3-1 11:43
wzkchem5 发表于 2022-7-14 01:36
可以。此外注意对Gd以及任何带显著电荷、和溶剂之间有很强的氢键的基团做显式溶剂化,并且最好做构象搜索

老师您好,如果做构象搜索,需要批量优化,找较低能量的过程也用这种计算精度吗?计算量会很大,这一步有推荐更低精度的方法吗?感谢老师!

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wzkchem5    时间: 2023-3-1 16:57
wangzh 发表于 2023-3-1 04:43
老师您好,如果做构象搜索,需要批量优化,找较低能量的过程也用这种计算精度吗?计算量会很大,这一步有 ...

构象搜索可以用GFN2-xTB,批量优化还是得用你说的这个水平,基本没什么降低的空间了




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