计算化学公社

标题: 关于用gromacs和用travis软件算RDF的问题 [打印本页]

作者
Author: reddy 时间: 2022-7-15 20:40
标题: 关于用gromacs和用travis软件算RDF的问题
本帖最后由 reddy 于 2022-7-15 21:20 编辑

我用gromacs的指令算RDF和用travis算出来的RDF相差太大，想请问那个更可靠一点？
RDF描述对象：离子液体中的阴离子对乙醇的RDF（做法：所有阴离子建一个group，所有乙醇建一个group）

(, 下载次数 Times of downloads: 7) (, 下载次数 Times of downloads: 6) ：用这个软件做RDF就是跟着指令做的，

下面是两种软件做的RDF图

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-15 22:38
我从来不用travis，我只能说gmx rdf程序本身是没有问题的
对比不同程序的rdf结果时注意：格点间距、统计的r范围、统计的组、统计的对象（如原子间还是分子质心间）、是否考虑时间平均，等等因素

贴图时候把每张图描述清楚，别人都不知道哪个图对应什么情况

提问时绝对不要用“跟着指令做的”这种含糊不明的描述，仔细看下文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

作者
Author: reddy 时间: 2022-7-16 08:50

sobereva 发表于 2022-7-15 22:38
我从来不用travis，我只能说gmx rdf程序本身是没有问题的
对比不同程序的rdf结果时注意：格点间距、统计的 ...

好谢谢

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)