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标题: 提问,关于T-REMD的执行脚本(已解决) [打印本页]

作者
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bdx    时间: 2022-7-20 10:45
标题: 提问,关于T-REMD的执行脚本(已解决)
本帖最后由 bdx 于 2022-7-21 10:16 编辑

根据网上找到的教程,脚本是这么写的 (, 下载次数 Times of downloads: 18)
然后我运行的时候提示mpirun:command not found, 我就把mpi的部分删了改成下面这样
(, 下载次数 Times of downloads: 16)
然后执行时出现如下错误
(, 下载次数 Times of downloads: 13)
想请问一下这个问题是什么原因导致的,是脚本的问题吗还是gromacs版本的问题(教程是2018,我用的是2022)

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chenbq18    时间: 2022-7-20 17:12
先把脚本里的mdrun命令在命令行运行测试一下,是否正常
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对抗路达摩    时间: 2022-7-20 23:47
似乎是2018或者某个版本之后就不能用 -multi来运行REMD了 要用-multidir 你输入gmx mdrun -h 看一下
而且最好是使用mpi编译的gmx版本 也就是和他命令相同的 不然我不确定是直接不可以做REMD 还是不可以用显卡做REMD
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bdx    时间: 2022-7-21 09:23
对抗路达摩 发表于 2022-7-20 23:47
似乎是2018或者某个版本之后就不能用 -multi来运行REMD了 要用-multidir 你输入gmx mdrun -h 看一下
而且 ...

谢谢,确实是的,提示必须要MPI




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