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标题: 关于molclus提供traj.xyz拆分计算的建议 [打印本页]

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ABetaCarw    时间: 2022-7-22 18:18
标题: 关于molclus提供traj.xyz拆分计算的建议
本帖最后由 ABetaCarw 于 2022-7-22 19:03 编辑

我自己常用xtb做结构初筛计算,发现xtb在多核并行效率偏低,比如36核计算,不如9+9+9+9开四个xtb同时算。
我的建议如下
对于比如含有200个结构的traj.xyz文件,提供一个选项,将目前系统的核数(比如36核),拆分成0-8核 计算1-50号结构,9-17计算51-100号结构,18-26计算101-150号结构,27-35计算151-200号结构
基本上可以同时计算结束,最大化利用系统资源。

虽然可以手动拆成4个traj.xyz文件开四个molclus窗口调用四个xtb,但肯定不如软件原生支持来得便捷。

作者
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丁越    时间: 2022-7-22 20:10
钟叔早已经把脚本写好啦(http://bbs.keinsci.com/thread-14361-1-1.html
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exity    时间: 2022-7-23 11:55
不是有crest吗?
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ABetaCarw    时间: 2022-7-23 23:08
丁越 发表于 2022-7-22 20:10
钟叔早已经把脚本写好啦(http://bbs.keinsci.com/thread-14361-1-1.html)

钟叔牛逼




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