计算化学公社

标题: 求助双精度gromacs安装到最后报错，出现“最后的链结失败” [打印本页]

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Author: likestudy 时间: 2022-7-23 13:51
标题: 求助双精度gromacs安装到最后报错，出现“最后的链结失败”
我是本来就装有GPU版gromacs的，现在准备再装一个双精度版，都是按照卢老师gromacs安装教程来操作的，请问大家这个问题如何解决

作者
Author: Frozen-Penguin 时间: 2022-7-23 13:58
根据提示信息：can not be used when making a shared object
建议在cmake的时候设置-DBUILD_SHARED_LIBS=OFF，然后把已经编译的内容删掉，重新编译

作者
Author: likestudy 时间: 2022-7-23 14:05

Frozen-Penguin 发表于 2022-7-23 13:58
根据提示信息：can not be used when making a shared object
建议在cmake的时候设置-DBUILD_SHARED_LIBS= ...

感谢，我现在试试

作者
Author: lyj714 时间: 2022-7-23 14:09
双精度GROMACS必须事先编译双精度的fftw3，而不是什么单精度（gpu gmx就用的单精度fftw），也就是上面提到的fftw3f这个是单精度的，并不适合双精度gmx

作者
Author: likestudy 时间: 2022-7-23 14:21
本帖最后由 likestudy 于 2022-7-23 14:25 编辑

lyj714 发表于 2022-7-23 14:09
双精度GROMACS必须事先编译双精度的fftw3，而不是什么单精度（gpu gmx就用的单精度fftw），也就是上面提到 ...

感谢回复，我是按照sob老师的教程，在编译fftw时去掉了--enable-float，得到的fftw338文件夹里有fftw3也有fftw3f

作者
Author: sobereva 时间: 2022-7-23 14:38
带f后缀的是float（单精度）版
确保严格按下文操作了，所有选项都设对了
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

装双精度版之前把之前的gmx目录换个改个名字，并且重新进入终端，免得残留的信息可能碍事

作者
Author: likestudy 时间: 2022-7-23 15:25

sobereva 发表于 2022-7-23 14:38
带f后缀的是float（单精度）版
确保严格按下文操作了，所有选项都设对了
GROMACS的安装方法（含全程视频 ...

好的，我改个名试下，感谢老师解答

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